而后就是一番改制，体现新朝新气象。
接下来就是对功臣们的大力册封
升郑芝龙为平虏侯、郑鸿逵为定虏侯，封郑芝豹为澄济伯、郑彩为永胜伯。
以黄道周为内阁首辅，蒋德璟为内阁次辅。
朱继祚为礼部尚书，曾樱为工部尚书、黄鸣俊、李光春、苏观生等人为礼、兵等各部左右侍郎兼东阁大学士。
为了拉拢人心
隆武元年七月底下令将嘉靖年间皇极殿、中极殿、建极殿三殿之名恢复为奉天殿、华盖殿、谨身殿，各衙门前加“行在”二字。
依据伦序，最有资格继承皇位的是广西的桂王，但桂王当时距离江南太远
而众明臣齐推唐王朱聿键的另外一个原因是他的封地在南阳。
这是东汉光武帝刘秀的起家之地。
众臣推唐王朱聿键为帝，想把他当作重振大明的标志。
很想让他暗合天意，争取做一个明朝的“光武帝”，复兴明朝。
但首先天公就不作美
隆武帝举行大典仪式当天，大风雾起，拔木扬沙，尚玺官的坐骑受惊，玉玺摔落，碰坏一角。
众人心惊，皆认为兆征不祥。虽然如此，隆武君臣还是很有平复天下的决心，锐意恢复。
而隆武帝也面临了一个与朱以海同样的问题：
军阀掌权
而在福建的，则为郑氏军阀。
如同傀儡隆武帝虽为英明之主，却一直为郑氏家族集团所架空。
以郑芝龙、郑鸿逵、郑芝豹、郑影为首的郑氏家族，都是大海盗头子出身。
数十年横行福建、广东、浙江一带沿海，兼商兼盗。
他们崇祯初年受招安后，趁天下大乱之际一直忙于扩大地盘，充实自己的私人力量。
郑家对隆武为数不多的忠臣，其实只有郑成功，还有一个郑鸿逵
郑芝龙有一次带郑成功入宫，隆武帝见之大悦
以手抚其背，说：“恨无一女配卿，卿为尽忠吾家，毋相忘也。”
赐郑森名成功，命为御林军都督、仪同驸马都尉
时人称之为“国姓爷”。
隆武帝此举，也有笼络郑氏家族的意思在里面。
但隆武帝想不到的是
他的这一举动直接将郑成功感动的稀里哗啦
郑氏家族傲慢无上，卖官鬻爵，大肆搜刮百姓，横毒凶暴，甚至超过弘光朝的马士英。
他们在败走江南时候，依然大肆抢掠。
时人有言：
“受害者延颈待清兵，谣曰‘清兵如蟹，曷迟其来！”
外有清军，内有武将掌权的情况下，南明爆发了着名的政治传统：
内斗！内斗！还是t的内斗！
朱聿键倒是掌控先机
命左副都御史陆清源携带白银十万两前往浙东犒师
然后
然后就被杀了
朱聿键一计不成，再生一计
由于朱以海政权中许多文官武将由于受到方国安、王之仁的排挤
于是纷纷向隆武朝廷上疏效忠
朱聿键于是加以笼络，给他们进官封爵。
而朱以海也不是吃素的，针锋相对采取挖墙脚措施。
竟直接贴脸开大
派左军都督裘兆锦、行人林必达来福京以公爵封郑芝龙兄弟。
朱聿键闻讯大怒，将来使囚禁。
不久，又杀朱以海所遣使者总兵陈谦。
正因隆武帝和鲁王两个人都为疏宗
所以，鲁王一方得知隆武帝称帝消息后，并未立即退位归藩。
双方各自手下的大臣为争拥立之功，自然都紧上疏要求不要退位，硬顶各自的“招牌”。
鲁王在手下的张国维、王之仁等人的怂恿下，表明他不承认隆武政权。
朱聿键怒，杀鲁王信使。
他急了，他急了
就在两个政权各起龌龊时，远在肇庆的朱亨嘉一片风生水起。