己丑日，南齐将南平王萧宝攸改封为邵陵王，蜀郡王萧子文改封为西阳王，广汉王萧子峻改封为衡阳王，临海王萧昭季改封为巴陵王，永嘉王萧昭粲改封为桂阳王。
十月，壬戌日，北魏下诏：“各州刺史认真考察所属官员，根据他们的政绩得失分为三等，上报朝廷。”又下诏：“徐州、兖州、光州、南青州、荆州、洛州六州，严格整顿军备，随时准备听候调遣集结。”十一月丁卯日，下诏废除世宗的东田（皇家园林），并拆毁兴光楼。
己卯日，南齐为太子萧宝卷迎娶褚氏为太子妃，大赦天下。褚妃是褚澄的女儿。
庚午日，孝文帝前往委粟山，确定圜丘（古代帝王祭天的场所）的选址。己卯日，孝文帝召集众儒生商议祭天的礼仪。秘书令李彪建议说：“鲁国人将要祭祀上帝，必定先在泮宫（古代学校）祭祀告慰祖先。请求在祭天前一天到太庙告祭。”孝文帝采纳了他的建议。甲申日，孝文帝在圜丘祭祀上天；丙戌日，大赦天下。
十二月乙未朔日，孝文帝在光极堂召见群臣，宣布官员品级制度，正式开始大规模选拔官员。光禄勋于烈的儿子于登援引旧例请求升官，于烈上表说：“如今圣明的朝政提倡廉洁谦让，而我的儿子于登却援引旧例谋求晋升；这是我平时没有好好教导他的过错，请求将他罢官！”孝文帝说：“这是有见识的话，没想到于烈能做到这样！”于是召见于登，对他说：“朕将要教化天下，因你父亲有谦逊的美德、正直的风范，所以提拔你为太子翊军校尉。”又加封于烈为散骑常侍，封为聊城县子。
孝文帝对群臣说：“国家自古以来有一件事令人叹息：臣子们不肯公开议论朝政的得失。君主的忧虑在于不能接纳劝谏，臣子的忧虑在于不能尽忠直言。从今以后，朕提拔某个人，如果他有不合适的地方，你们要直言指出他的过失；如果有有才能却不被朕所知的人，你们也应当举荐他。这样一来，能举荐贤才的人有赏赐，知情不言的人要治罪，你们应当明白这一点。”
甲子日，孝文帝在光极堂召见群臣，赏赐他们冠服（符合汉制的帽子和礼服）。
在此之前，北魏人不曾使用钱币，孝文帝开始下令铸造太和五铢钱。这一年，钱币铸造大致完备，下诏朝廷和民间都可以使用。
北魏任命光城蛮（古代南方少数民族）首领田益光为南司州刺史，他所统辖地区的地方官员，允许他自行选拔任命。后来又在新蔡设立东豫州，任命田益光为刺史。
时间很快就到了公元496年春季，正月丁卯日，南齐任命杨炅的儿子杨崇祖为沙州刺史，封为阴平王。
紧接着，就发生了一件大事，北魏孝文帝下诏，诏书内容为：“北方人把‘土’称为‘拓’，把‘后’称为‘跋’。北魏的祖先源自黄帝，以土德称王，因此姓拓跋氏。土是黄色的中心颜色，是万物的本源；应当改姓为元氏。各位从代都来的功臣旧族，姓氏有的重复，都要更改。”于是开始将拔拔氏改为长孙氏，达奚氏改为奚氏，乙旃氏改为叔孙氏，丘穆陵氏改为穆氏，步六孤氏改为陆氏，贺赖氏改为贺氏，独孤氏改为刘氏，贺楼氏改为楼氏，勿忸于氏改为于氏，尉迟氏改为尉氏；其余更改的姓氏，不计其数。
孝文帝向来重视门第宗族，认为范阳卢敏、清河崔宗伯、荥阳郑羲、太原王琼这四姓，是士大夫群体所推崇的名门，于是全都娶他们的女儿充实后宫。陇西人李冲因才能见识被重用，在朝中地位尊贵，他缔结的姻缘，没有不是名望清高的家族；孝文帝也娶他的女儿为夫人。下诏令黄门郎、司徒左长史宋弁审定各州的士族等级，对许多家族的品级进行了升降调整。又下诏说：“代都人原本没有姓氏宗族之分，即便是功臣贤人的后代，也与贫寒低贱之人没有区别；因此有的人身居公卿高位，而他的近亲却仍在担任卑微的官职。其中穆、陆、贺、刘、楼、于、嵇、尉八姓，从太祖以来，功勋卓着于当世，地位皆至王公，是显而易见的名门望族，可下令司州、吏部，不要让他们担任卑微官职，待遇与四姓相同。除此之外，应当列入士族之列的家族，随后再另行下诏规定。那些过去是部落首领，且从皇始年间以来三代官职在给事以上以及品级达到王公的，定为‘姓’；如果原本不是部落首领，但从皇始年间以来三代官职在尚书以上以及品级达到王公的，也定为‘姓’。部落首领的后代但官职不显达的定为‘族’；如果原本不是部落首领但官职显达的，也定为‘族’。所有这些姓族，都应当仔细审核，不容许有假冒伪劣者。命令司空穆亮、尚书陆琇等人详细审定，务必做到公平恰当。”陆琇是陆馛的儿子。
北魏旧制度规定：王国的侍从官都应娶八姓以及清高修洁人家的女儿。咸阳王元禧却娶了奴仆身份的女子为侍从官之妻，孝文帝严厉斥责了他，并趁机下诏为六个弟弟聘娶正室：“以前所娶的妻子，可以作为妾侍。咸阳王元禧，可聘娶已故颍川太守陇西人李辅的女儿；河南王元干，可聘娶已故中散大夫代郡人穆明乐的女儿；广陵王元羽，可聘娶骠骑咨议参军荥阳人郑平城的女儿；颍川王元雍，可聘娶已故中书博士范阳人卢神宝的女儿；始平王元勰，可聘娶廷尉卿陇西人李冲的女儿；北海王元详，可聘娶吏部郎中荥阳人郑懿的女儿。”郑懿是郑羲的儿子。
当时赵郡的李氏家族，人才尤其众多，各自弘扬家风，因此当时谈论名门望族的人，将五姓（卢、崔、郑、王、李）列为首位。
众人商议认为薛氏是河东的名门望族。孝文帝说：“薛氏是蜀地的家族，怎么能列入郡中望族！”直阁薛宗起手持戟站在殿下，走出队列回应道：“我的祖先在汉末时便在蜀地做官，两代后又返回河东，如今已经传承了六代，不再是蜀地人了。臣认为陛下是黄帝的后代，在北方受封，难道也能称之为胡人吗！如今薛氏不能列入郡中望族，我活着还有什么意义！”于是将手中的戟摔碎在地上。孝文帝缓缓说道：“那么朕是第一等，你是第二等吗？”于是将薛氏列入郡中望族，还说：“你不是‘宗起’，而是‘起宗’啊！”
孝文帝与群臣讨论选拔调派官员的事，说：“近代以来，官职的高低根据出身来定，各有固定的名分；这到底怎么样？”李冲回答说：“不知道从上古以来，设置官职排列爵位，是为了富贵人家的子弟，还是为了实现天下大治呢？”孝文帝说：“当然是为了实现天下大治。”李冲说：“既然如此，那么陛下如今为什么专门根据门第品级选拔官员，而不提拔有才能的人呢？”孝文帝说：“如果有超出常人的才能，不愁不被发现。然而君子的家族，即便没有当代合用的才能，终究德行纯正笃厚，所以朕才任用他们。”李冲说：“傅说、吕望这样的人才，难道能通过门第得到吗！”孝文帝说：“这样非同寻常的人，很久才能出现一两个罢了。”秘书令李彪说：“陛下如果专门根据门第选拔官员，不知道鲁国的三卿，与孔门的四科（德行、言语、政事、文学）相比，谁更优秀呢？”着作佐郎韩显宗说：“陛下怎么能让富贵的人代代富贵，贫贱的人代代贫贱呢！”孝文帝说：“如果确实有高明卓绝、出类拔萃的人，朕也不会受此制度拘束。”不久，刘昶入朝，孝文帝对他说：“有人说应当只依靠才能，不必拘泥于门第；朕认为不是这样。为什么呢？如果清浊同流，混杂为一等，君子和小人的名分品级没有区别，这实在是不行。如今我朝八族以上的士人，品级分为九等，九品之外，出身低微的人担任的官职又有七等。如果有才能出众的人，可以从平民直接提拔为三公。只是担心贤才难得，不能因为一个人而扰乱我的典章制度。”
对此，司马光说：“选拔人才的制度，先看门第而后看贤才，这是魏晋时期的严重弊病，而历代沿袭，没有谁能改变。君子与小人的区别，不在于是否世袭俸禄和出身卑微。从今天的角度来看，这是愚人和智者都明白的道理。在当时，即便是贤明的魏孝文帝，也不免受到这种弊病的影响。因此能够明辨是非而不被世俗观念迷惑的人，实在是太少了！”壬辰日，北魏将始平王元勰改封为彭城王，恢复定襄县王元鸾为城阳王。
二月壬寅日，北魏下诏：“君臣除非遇到战争，都允许守满三年的丧期。”
丙午日，北魏下诏：“京城周围七十岁以上的老人，在暮春时节前往京城参加养老礼。”三月丙寅日，孝文帝在华林园宴请群臣以及国老、庶老。下诏：“国老中，八十岁以上的，授予中散大夫、郡守的虚职；七十岁以上的，授予给事中、县令的虚职。庶老，直接授予郡、县的虚职，各自赏赐鸠杖、衣裳。”
丁丑日，北魏下诏：“各州的中正官各自举荐本乡德高望重、五十岁以上坚守本分、隐居乡里的人，授予县令、县长的官职。”
壬午日，南齐下诏：“皇帝车辆上有金银装饰的部件，全部剔除。”
南齐皇帝萧鸾立志崇尚节俭。太官曾进献裹蒸（一种食物），萧鸾说：“我吃不完这个，可以切成四块，剩下的作为晚餐。”又曾使用皂荚，将剩下的皂荚水交给身边侍从说：“这个还能再用。”太官在元旦向皇帝祝寿，献上银酒杯，萧鸾想要把它毁掉；王晏等人都称赞皇帝的盛德，卫尉萧颖胄说：“朝廷的盛大礼仪，没有比元旦、冬至、夏至这三元更重要的了。这一个银器既然是旧物，算不上奢侈。”萧鸾听后不高兴。后来参加私人宴会，席上摆满了银器。萧颖胄说：“陛下之前想要毁掉银酒杯，恐怕应该把这种想法用在这些银器上。”萧鸾感到十分惭愧。
萧鸾亲自处理琐碎事务，法令章程也十分繁琐，于是郡县以及六署、九府的日常公务，没有不奏报朝廷的，都要等待皇帝的诏令来决定。文武功臣旧臣，都不再归吏部选拔任用，皇帝身边亲近的人凭借权势，互相引荐，官场的事务过于繁杂琐碎。南康王侍郎颍川人钟嵘上书说：“古代，圣明的君主根据才能分配政务，衡量能力授予官职，三公坐着讨论治国之道，九卿负责具体事务并完成，天子只需要恭敬地坐在朝堂上而已。”奏章呈上后，萧鸾很不高兴，对太中大夫顾暠说：“钟嵘是什么人，想要干涉朕的政务！你认识他吗？”顾暠回答说：“钟嵘虽然地位低下、名声不显，但他所说的或许有值得采纳的地方。况且繁琐琐碎的事务，各有专门的部门负责；如今君主亲自总揽一切，导致君主更加劳累而臣子更加安逸，这就是所说的‘代替厨师做饭、代替工匠砍木头’啊。”萧鸾没有回应，转而谈论其他事情。
夏季四月甲辰日，北魏广州刺史薛法护前来投降南齐。
五月丙戌日，北魏在河阴修筑方泽（古代帝王祭祀地神的场所）。又下诏规定，汉、魏、晋各位皇帝的陵墓，周围百步之内禁止砍柴割草。丁亥日，孝文帝在方泽举行祭祀地神的仪式。
秋季七月，北魏废黜皇后冯氏。起初，文明太后想要让自己的家族显贵，挑选冯熙的两个女儿进入后宫，其中一个早年去世，另一个得到孝文帝的宠爱，不久生病，回到家中做了尼姑。等到文明太后去世，孝文帝立冯熙的小女儿为皇后。后来皇后的姐姐病愈，孝文帝思念她，又将她迎入宫中，封为左昭仪；皇后的宠爱逐渐衰减。左昭仪自认为年长，而且先进入宫中，不遵守妾妃的礼仪。皇后感到十分惭愧怨恨，左昭仪趁机诬陷皇后，导致皇后被废黜。皇后向来有德行操守，于是居住在瑶光寺做了修行的尼姑。
孝文帝因为长期干旱，从癸未日开始停止进食，直到乙酉日，群臣都前往中书省请求晋见。孝文帝在崇虎楼，派侍从官推辞不见，并且询问群臣前来的原因。豫州刺史王肃回答说：“如今京城四周郊外已经下了充足的雨，只有京城的雨稍微少一些。平民百姓还没有缺少一顿饭，而陛下已经三天没有进食了，臣下们惶恐不安，再也没有安心的地方了。”孝文帝派侍从官回应说：“朕已经几天没有进食了，仍然没有感受到上天的回应。近来朝廷内外无论贵贱，都说四周郊地下了雨，朕怀疑他们想要宽慰朕，未必是实情。朕正要派人去查看，如果果然像他们所说的那样，就立即进食；如果不是这样，朕活着还有什么意义！应当用自己的生命为万民承担罪责！”当天晚上，天降大雨。北魏太子元恂不好好学习，身材向来肥胖，苦于河南地区气候炎热，常常想要返回北方。孝文帝赏赐给他汉人的衣冠，他却常常私下穿着胡人的服饰。中庶子辽东人高道悦多次恳切劝谏，元恂十分厌恶他。八月戊戌日，孝文帝前往嵩高，元恂与身边的人密谋，召集放牧的轻骑兵逃往平城，在宫中亲手杀死了高道悦。领军元俨率兵守住宫门，防止事态扩大，直到入夜才平定下来。第二天清晨，尚书陆琇骑马疾驰前往奏报孝文帝，孝文帝大为震惊，隐瞒了这件事，仍然前往汴口后才返回洛阳。
甲寅日，孝文帝进入宫中，召见元恂，列举他的罪状，亲自与咸阳王元禧等人轮流杖打他一百多下，将他搀扶着拖出宫去，囚禁在城西；一个多月后元恂才能起身。
丁巳日，北魏相州刺史南安惠王元桢去世。
冬季十月戊戌日，北魏下诏：“从代都来的士兵，都任命为羽林、虎贲。司州的百姓，十二个成年男子中抽调一个，充当官吏，以供公私劳役使用。”
这时，北魏吐京胡反叛，下诏令朔州刺史元彬代理汾州事务，率领并州、肆州的军队前去讨伐。元彬是元桢的儿子。元彬派统军奚康生攻打反叛的胡人，击败了他们，一直追击到车突谷，再次击败叛军，缴获的各种牲畜数以万计。下诏任命元彬为汾州刺史。胡人去居等六百多人占据险要地势，拒不投降，元彬请求调拨两万兵力前去讨伐，有关部门上奏批准了他的请求，孝文帝大怒说：“小小的寇贼，哪里有调动大军的道理！可以根据情况自行讨伐平定。如果不能攻克，必须动用大军，就先斩杀刺史，然后再发兵讨伐！”元彬听后十分恐惧，督促率领州中的军队，亲自冲在将士前面，讨伐去居，将叛乱平定。
孝文帝在清徽堂召见群臣，商议废黜太子元恂。太子太傅穆亮、少保李冲摘下官帽，叩头请罪。孝文帝说：“你们所请罪的是私人情谊，我所商议的是国家大事！‘大义灭亲’，是古人所推崇的。如今元恂想要违背父亲，逃跑反叛，占据恒州、朔州，天下的罪恶没有比这更大的了！如果不除掉他，将会成为国家的祸患。”闰十月丙寅日，废黜元恂为平民，将他安置在河阳无鼻城，派兵看守，供给的饮食衣物，仅仅能够避免饥饿寒冷而已。
戊辰日，北魏设置常平仓（古代调节粮价、储备粮食的粮仓）。
戊寅日，南齐太子萧宝卷举行冠礼。
起初，北魏文明太后想要废黜孝文帝，穆泰恳切劝谏，才使太后打消了念头，穆泰因此受到孝文帝的宠爱。等到孝文帝南迁洛阳，所亲近信任的大多是中州的儒士，宗室以及代都人往往不高兴。穆泰从尚书右仆射调任定州刺史，他自称长期患病，在温暖的土地上病情会加重，请求调任恒州；孝文帝为他将恒州刺史陆睿调任定州，让穆泰代替陆睿担任恒州刺史。穆泰到任后，陆睿还没有出发，于是两人一起密谋叛乱，暗中勾结镇北大将军乐陵王元思誉、安乐侯元隆、抚冥镇将鲁郡侯元业、骁骑将军元超等人，共同推举朔州刺史阳平王元熙为盟主。元思誉是元天赐的儿子；元业是元丕的弟弟；元隆、元超都是元丕的儿子。陆睿认为洛阳政治清明，劝穆泰暂缓行动，穆泰因此没有立即发动叛乱。
元颐假装答应穆泰等人，以安定他们的情绪，同时暗中将情况奏报给孝文帝。代理吏部尚书任城王元澄患病，孝文帝在凝闲堂召见他，对他说：“穆泰图谋不轨，煽动引诱宗室叛乱。如果叛乱真的发生，如今迁都刚刚不久，北方人留恋旧土，南北局势将会动荡不安，朕在洛阳就无法立足了。这是国家大事，除了你没有人能够办理。你虽然患病，也要勉强为我北行，仔细观察事态的发展。如果他们势力微弱，就直接前去擒获他们；如果他们已经强盛，就可以秉承朕的旨意调动并州、肆州的军队攻打他们。”元澄回答说：“穆泰等人愚昧糊涂，只是因为留恋旧土，才想出这样的计策，并没有深谋远虑；臣虽然平庸胆怯，但足以制服他们，希望陛下不要担忧。即使身患疾病，我又怎敢推辞呢！”孝文帝笑着说：“任城王愿意前往，朕还有什么可担忧的！”于是授予元澄符节、铁虎符、竹使符以及宫中的护卫，仍然让他代理恒州事务。
元澄行进到雁门，雁门太守连夜报告说：“穆泰已经率领军队向西去投靠阳平王元熙了。”元澄立即下令进军。右丞孟斌说：“事态还不可预料，应当按照陛下的诏令召集并州、肆州的军队，然后再慢慢前进。”元澄说：“穆泰既然图谋叛乱，就应该占据坚固的城池；现在反而去迎接阳平王元熙，推测他的所作所为，应该是势力薄弱。穆泰既然没有前来抵抗，无故调动大军，不合适。只要迅速前往镇守恒州，民心自然会安定下来。”于是加速行军，日夜兼程。先派遣治书侍御史李焕单人匹马进入代都，出其不意地告知穆泰的党羽，向他们说明祸福得失，这些人都不再为穆泰所用。穆泰无计可施，率领部下数百人攻打李焕，没有攻克，逃到城西；李焕率军追击，将他擒获。元澄也很快赶到，彻底追查叛乱的党羽，逮捕了陆睿等一百多人，全部关进监狱，民间安定无事。元澄详细将情况上奏给孝文帝，孝文帝十分高兴，召集公卿大臣，将元澄的奏章拿给他们看，说：“任城王可以说是国家的栋梁之臣啊。看他审讯的供词，即便是古代的皋陶也比不上他！”又回头对咸阳王元禧等人说：“如果让你们去处理这件事，肯定办不好。
北魏孝文帝谋划入侵南齐，在清徽堂召见公卿大臣，说：“朕在中原选定都城，各项制度已经大致确立；唯独南方的敌寇尚未平定，怎能效仿近代的天子，整天安居在深宫之中呢！朕如今南征的决心已定，只是还没确定出发的早晚日期。近来术士们都说，现在出兵必定能攻克。这是国家的大事，各位大臣应当畅所欲言，不要因为朕先表了态，就当面含糊其辞，事后又提出不同意见。”
李冲回答说：“但凡用兵之道，应当先考虑人事，再观察天道。如今占卜虽然显示吉利，但人事方面尚未准备妥当：迁都刚不久，今年秋天的谷物没有丰收，不宜发动军队出征。依臣之见，应当等到明年秋天再出兵。”
孝文帝说：“去年，朕率领二十万大军南征，当时人事方面的准备十分充分，却因天时不利而未能成功。如今天时顺遂，又说人事未备，要是按仆射你所说的，那我们就永远没有征伐南方的时机了。敌寇近在咫尺，日后必将成为国家的祸患，朕怎敢安心度日！如果今年秋天出征不能取胜，各位就都要被交付司寇治罪，到时可不要不尽心尽力啊。”
北魏孝文帝因为被判罪流放边疆的人大多逃亡，于是制定法令：若一人逃亡，全家都要服劳役。光州刺史博陵人崔挺上书劝谏说：“天下善人少，恶人多。如果一人有罪，牵连全家，那么像司马牛那样，因为兄长桓魋作乱，自身却要受罚，像柳下惠那样，因为弟弟盗跖为恶，自身却要遭诛，这难道不令人悲哀吗！”孝文帝认为他说得有道理，便废除了这一法令。
一个靠阴谋建立的政权，即使取得了对外战争的胜利，也难以根除其内在的合法性危机。萧鸾在战场上赢得的威望，并未转化为朝堂的向心力，反而加深了他对所有人的猜疑。这种源于开端的“不安全感”，如同一个诅咒，将继续笼罩南齐的建武时代，直至其终局，多么可悲！