当然，趁着这次索要唐媚的机会，汝宁军也接连攻下了原先由左良玉部控制的好几座城池。不过在攻打过程中，汝宁军也未受到什么抵抗，先后俘虏、收编了左良玉部一万多人。
正月初三。大西军的先头部队从团风洲渡江，克武昌县。十五日，大西军全军自鸭蛋洲南渡。二十日进攻武昌府城。明道臣王扬基眼看形势不妙，同武昌府推官傅上瑞弃城逃跑。楚府新兵随即大开保安、文昌二门投降。
大西军入城后活捉朱华奎，尽取宫中金银各百万。辇载数百车不尽。张献忠见了不禁叹息道：“有如此金钱不能设守，朱胡子真庸儿”
之后。张献忠下令把朱华奎扔进河中淹死。而贺逢圣被俘后。张献忠以其劣迹不著，释放回家。贺却说，“我大臣，不可苟活”，自己跑到滋阳湖王会桥投水而死。
与此同时，在十八日。从汝宁、南阳出发的汝宁军经过夜行军，奇袭随州，一日肃清了到武昌城的道路。
十九日，均州出发的江澄部攻至襄阳。而张献忠留在襄阳的文官也是从大明投降过去的。而张献忠为了保证能攻克武昌，他就集中了大西军绝大多数主力，所以留在襄阳城内的也只有四千余士兵。因此，见到了汝宁军大军压境，襄阳城根本就没有抵抗，举城投降。而襄阳城的归降，又为汝宁军扫清了一条去武昌的道路。
再加上已经集中在黄冈的汝宁军和长江江面上的炮舰，汝宁军已经隐隐形成了对武昌三面包围的架势。
所以就在张献忠的大西军欢庆攻克武昌的时候，他们却突然发现，自己已经在不知不觉中，陷入到了汝宁军的重围中去了。
为此，张献忠当机立断决定放弃武昌城，他除了在城中留下李定国所率领的二万人马以外，自己率领着主力渡过长江，全军向西而去。这次张献忠就决定要远远地离开汝宁军的地盘，他的目标就是四川，要在天府之国内建立自己独立的小王国。
至于留在武昌城内的李定国，就希望他拖延汝宁军的时间长一些。等到张献忠的大西军主力远遁而去以后，再让李定国突围相随。
可是汝宁军的动作却相当快。二十四日，随州的汝宁军赶到武昌，他们在江面上炮舰的配合之下，打死、俘虏了大西军后卫，未过河人员三万多。接下来的两日，其他两路汝宁军也先后赶到，他们共同就把武昌城团团地包围了起来。
而入关的清军在腊月二十五日攻克德州以后，全军就像潮水般涌入了山东。进入山东以后，清军开始分成了一股股几千到上万的部队，分散到各个州县抢掠。
而山东巡抚颜继祖和总兵刘泽清只把鲁军主力集中在了济南城内，不再管其他城池的死活，任由清军的自由活动，这也造成了山东北部和中部地区完全就是一副地狱惨象。
不过在抢掠了一个月左右，皇太极下令全军集中，准备进行下一步的战略攻入河南。
由于此次清军的目标，是处在豫南地区的汝宁和归德，所以清军就分兵两路，一路二万兵马，在多铎的率领下，在攻克的济宁之后，沿着菏泽地区杀入河南；另一路十多万清军主力，就在皇太极的亲自率领下，要通过徐州攻入归德。
而薛永利部原先是把部队集中在了豫东北地区，只防备了从济宁攻入的这一路。当得知了清军的两路动向以后，薛永利急令书墨率领归德镇，先赴徐州帮助抵御清军的侵入。而薛永利自己，则率领四个镇，共五万六千多人马，首先要击退多铎的大军，之后再赴徐州加入到决战中。
所以自二月初二始，菏泽徐州大战当即爆发了。
不过在所有的战区中，首先爆发的就是李自成顺军和孙传庭秦军的决战。
当李自成得知秦军将要出陕的消息以后，他一边在太原进行着自己的“开国大典”；一边就源源不断地调兵，要加强山西的防务。接着李自成又亲统大军西行，要集中兵力准备迎战孙传庭的秦军进犯。
而在战略上，李自成就根据：西北地区由于天灾造成了赤地千里，大军过后粮草问题不易解决的状况，决定在战略上采取诱敌深入的方针，把主力部署在临汾以北地区。至于之前的广阔地带，除留下为数不多的巡逻部队以外，连州县城池都全部放弃，不留一兵一卒来守卫。
而在崇祯十六年正月上旬，秦军重占运城。孙传庭左右的谋士就提出建议：不要急于冒进，应采取稳扎稳打的办法，先以运城为基地，修复城堞，招徕流民，开屯田，储粮草，这样进可以战，退可以守，待时机成熟时再进取太原。
可是孙传庭终畏朝命，不敢逗留，还是领兵向北进发。为了保证军需，孙传庭严令由四周各府、县协解粮草，而地方官催逼甚急，逼死、累死百姓甚多。
而李自成见孙传庭部来势凶猛，便故意示弱，只派出小部队稍加阻击随即北撤。秦军轻而易举地直打到闻喜县。而这意外的胜利也使孙传庭信心变得膨胀了起来。
当然，孙传庭搜罗的那些各色部队也都是原形毕露，他们沿途滥杀居民，斩级计功。而孙传庭也对此种杀良冒功行为是不闻不问，反而向朝廷报捷说：“贼闻臣名皆溃。臣誓清山西，不以一贼遗君父忧。”
于是崇祯皇帝得报大喜，欣欣然把孙传庭的报捷书交由朝臣传阅，并梦呓般地叫嚷：“贼灭亡在旦夕”甚至还急不可耐地面谕吏、兵，工三部：“督师驻兵晋中，屡报战胜，土寨多已招安。各镇、抚宜整旅渡河，星速赴任。规避不前者飞参重治。一面招抚流移，开垦荒芜；一面修复城池，安插民众。仍饬河北各府输輓粮草，接济督师，河南附近地方派运不得迟误，功收万全。通侯之赏，断不少靳。”
看起来，崇祯皇帝已经被这久违的胜利冲昏了头脑了。他似乎已经开始准备给功臣们加官论赏。但兵部尚书冯元飙却忧心如焚地顿首说：“贼故见羸以诱我师，兵法之所忌也。臣不能无忧。”弄得崇祯皇帝是大为扫兴，好半天说不出话来。
而此次的孙传庭也吸取了以前几次官军被了农民军挖沟围杀的教训，更为了抵御住闯营那人数众多的骑兵，他就采用了戚继光流传下来的偏厢车战术。
在出陕之前，秦军打造了大量的大车，征募了大量的骡马。而骡马不够，就征用了大量的民夫，要用人力来拉车。并且还在大车上装满了粮草，要对李自成的顺军采取步步逼进的战术。
因此，秦军的这一路也就变成了血腥的一路。只要见到百姓，年轻的男子全部征用为民夫，女子充为营妓，而年老的就砍了