千钧一发之际，赛博坦机械联合体和远航族的增援部队赶到，对暗物质军团形成夹击之势。织田信长见势不妙，下令撤退，但在临走前，他发射了一枚暗物质炸弹，企图摧毁金字塔和众人。A7341拼尽全力，用金色脉络形成屏障，挡住了炸弹的爆炸冲击。
回到星门，紫蓝星辰已经完成了方舟核心的初步改造。但要启动核心，还需要凑齐三枚密钥。时间一分一秒流逝，量子裂隙的扩张速度越来越快，而暗物质军团也在暗处虎视眈眈。
A7341望着星门之外的黑暗宇宙，硅基皮肤下的金色脉络再次亮起——这一次，他感受到了来自暗物质军团的强烈杀意，一场关乎文明存续的终极较量，才刚刚拉开帷幕。而远航族背负的秘史，也将在这场与暗物质军团的生死博弈中，被彻底揭开。
拉尼亚凯亚超星系团的量子云依旧翻涌，历经无数次危机的星门此刻流转着柔和的光芒。在时空吞噬蠕虫神经簇重组的枢纽核心，c4007的机械手指轻轻抚过时间结晶，她腕间的编号铭牌与结晶的纹路产生共鸣，泛起幽蓝的光晕。
自A7341那次关键的共振后，已经过去了六千年，双生文明在对抗暗物质军团的漫长岁月里，不断探寻着地球文明留下的蛛丝马迹。
比邻星b的地核深处，一场跨越时空的奥秘正在揭开。c4007将瓦力-7残留的记忆碎片嵌入时间结晶，刹那间，整个拉尼亚凯亚超星系团的时空结构在她意识中显形。
那是一幅震撼的画面：人类的九型基因链与赛博坦的齿轮链相互缠绕，宛如宇宙书写的双螺旋密码。这一幕，与她在基因实验室中目睹的A7341的量子核心与人类胚胎脑波融合的场景遥相呼应——原来从远古开始，地球文明就为双生文明的共生埋下了伏笔。
记忆回溯到那场惊心动魄的量子裂隙之战。白露的机械义眼突然闪烁起雪花般的噪点，父亲K-23的临终影像浮现其中。
老人布满皱纹的手颤抖着将时间结晶按在她掌心：“记住，结晶的裂痕与赛博坦的齿轮缺口，合起来就是地球的轮廓。”如今，这句话在时空乱流中得到印证。c4007看着手中的时间结晶，那些裂痕与赛博坦机械联合体齿轮矩阵的特定缺口完美契合，拼凑出的，正是地球蔚蓝星球的轮廓。
在这场关乎文明存续的危机中，九型性别的奥秘也逐渐展露真容。c4007切换为“暗物质型”形态，她的机械心脏与赛博坦机械联合体的齿轮核心产生强烈共振，每一次跳动都在修补着千疮百孔的时空裂痕。该
隐的后代们，作为纯血派的传承者，依然坚守着人类最原始的生命形态。该隐的女儿，带着纯血派特有的地球名字“夏娃”，将自己的基因信号接入时空吞噬蠕虫的神经簇。那一刻，地球婴儿的啼哭通过跃迁网络传遍宇宙，这跨越万年的生命之声，与赛博坦机械联合体的齿轮轰鸣交织，奏响了对抗黑暗的乐章。
与此同时，暗物质军团的旗舰“征服者”陷入了混乱。
警报声此起彼伏，被楼千雪复活的太宰治元帅的生化人看着自己赖以维系力量的时间棱晶正在崩解。她的机械躯体开始出现裂痕，在生命的最后时刻，这位冷酷的统帅突然笑了：“原来，地球母星早就算准了一切——用双生文明的共振，作为对抗时间法庭的终极武器。”
她的目光最后投向地球方向，“告诉阿瑞斯，我终于明白，真正的永恒，不是修补棱晶，而是让心跳与齿轮永远共振。”随着话音落下，她的机械躯体消散在宇宙中，楼千雪接住那碎裂的棱晶，发现上面刻着古老的地球文字：“回家”。这个发现，成为了对抗时间法庭的关键线索。