铁木真与哲别率领六万尸兵，坐镇九州岛，重点清剿南部萨摩藩与长州藩的残余势力。萨摩藩主岛津义久拥兵两万，擅长海战与山地战，其麾下的“萨摩隼人”武士战力强悍，且拥有数十艘战船，妄图从海上逃窜或偷袭。
“萨摩藩水师猖獗，需先破其战船，再攻其城。”铁木真头戴金盔，手持马鞭，“哲别，你率两万尸兵，用尸气弩箭射杀水师战船的士兵；我率四万尸兵，围攻萨摩藩首府鹿儿岛城！”
哲别领命，率尸兵驻守沿海，尸气弩箭射程远超普通弓箭，精准射向海上的萨摩战船。战船士兵纷纷中箭倒地，尸毒发作，战船失去操控，在海上漂浮。铁木真则率尸兵围攻鹿儿岛城，城头上的武士们疯狂抵抗，却在尸兵的悍勇进攻下节节败退。
岛津义久见水师被破，城防岌岌可危，率亲信试图从后门逃窜，被哲别的骑兵尸兵追上。哲别一箭射穿岛津义久的战马，将其生擒。鹿儿岛城被攻破后，顽抗的武士被转化为尸兵，沿海的海盗据点也被逐一清剿。
九州岛的清剿历时十日，不仅稳固了之前的占领区，还将尸兵兵力扩充至七万，沿海防线彻底稳固，杜绝了外部势力的干涉。
第四路·北海道征伐·虾夷收服
王重阳与一灯大师率领六万尸兵，北上征伐北海道。北海道气候寒冷，虾夷部落在此定居，部落首领阿伊努族酋长率一万部落勇士，凭借冰雪地形，抵抗尸兵的进攻。
“北海道冰雪覆盖，尸兵战力或受影响，需以智取。”王重阳道袍翻飞，先天功真气凝聚，“一灯大师，你以佛气安抚部落百姓，我率尸兵主攻部落据点，尽量减少杀戮。”
一灯大师颔首，双手合十，佛气弥漫，对着部落百姓高声道：“我主丁大材一统天下，善待归顺者，若你们放下武器，可保留部落自治，减免赋税！”
部落百姓们本就对战争充满恐惧，听闻此言，纷纷动摇。阿伊努族酋长见状，怒不可遏，率勇士们发起冲锋。王重阳率尸兵迎击，先天功真气化作光幕，挡住勇士们的攻击，尸兵们则以非致命方式将其生擒。
被生擒的部落勇士，在尸气催化药剂的作用下，转化为低级尸兵，他们熟悉冰雪地形，成为征伐的向导。阿伊努族酋长见大势已去，且百姓们纷纷归顺，只得放下武器，向王重阳与一灯大师投降。
北海道的征伐历时十五日，不仅收服了虾夷部落，还利用当地的冰雪资源，训练尸兵适应寒冷环境，兵力扩充至六万五千，北疆彻底平定。
第五路·海上清剿·外援断绝
霍都与蒙哥率领六万尸兵，乘坐战船，在东瀛海域展开清剿。东瀛残余水军与海盗勾结，拥有战船百余艘，在近海劫掠物资，支援陆上顽抗势力。
“海上作战，需利用尸兵刀枪不入、不畏水的优势。”霍都立于战船船头，弯刀指向远方，“蒙哥，你率三万尸兵，乘坐小艇，突袭海盗战船；我率三万尸兵，用投石机与尸气弩箭，摧毁其战船！”
蒙哥领命，率尸兵乘坐小艇，在海浪中穿梭，靠近海盗战船后，纵身跃上船板，弯刀挥舞，斩杀海盗与水军士兵。尸兵们在船上如履平地，即便落入水中，也能迅速爬上战船，继续战斗。
霍都则下令投石机发射巨石，砸向海盗战船，战船被砸得粉碎；尸气弩箭齐发，射向船上的士兵，中箭者瞬间倒地。海盗与残余水军见状，吓得魂飞魄散，纷纷弃船逃窜，却被尸兵们追上，尽数生擒或斩杀。
海上清剿历时八日，百余艘海盗与残余水军战船被尽数摧毁，沿海航道被彻底打通，陆上顽抗势力的外援被断绝。尸兵兵力扩充至七万，战船数量也有所增加，形成了对东瀛海域的绝对控制。
五路汇合·东瀛定鼎
一月之后，五路大军按时于江户城汇合。此时，各路人马的尸兵总数已从最初的三十万扩充至四十二万，新增的十二万尸兵皆为东瀛顽抗者转化而来，熟悉当地地形与战力，成为大尸王朝的重要战力。
江户城内，丁大材端坐临时搭建的龙椅之上，五路主将依次禀报清剿情况：本州岛、四国岛、九州岛、北海道尽数平定，残余顽抗势力被彻底肃清，东瀛诸藩尽数归顺，百姓安居乐业，赋税制度初步建立。
“很好！”丁大材眼中闪过满意，尸皇威压暴涨，“东瀛已彻底纳入我大尸王朝版图！传我令：在江户城设立‘东瀛都护府’，由杨过担任都护，派驻十万尸兵驻守；封归顺的藩主为‘东瀛尸伯’，继续统领各自领地，按时上缴赋税；将东瀛的资源尽数整合，粮草、矿产、马匹运往中原与西域边境，为决战尸祖做准备；全军休整半月，半月之后，班师回朝！”
“遵令！”众尸将齐声领命，煞气直冲云霄，震彻东瀛。
半月后，丁大材率领四十二万大军，乘坐战船，从江户城出发，返回襄阳。东瀛的玄黑旗在各都护府、藩领地的城头猎猎作响，标志着这个东岛彻底归入大尸王朝的统治。
远在西域的黑风戈壁，尸祖感受到东瀛彻底平定的气息，周身死气与煞气暴涨，形成一道遮天蔽日的黑影，眼中幽光闪烁，古老而威严的声音带着滔天杀意：“丁大材，你竟真的一统天下！但无妨，三百万幽冥鬼兵已蓄势待发，待你班师回朝，便是你僵尸帝国覆灭之日！”
黑衣斗篷怪客侍立一旁，眼中满是狂热：“尸祖大人，丁大材的大军虽增至四十二万，却长途征战、疲惫不堪，且新增尸兵战力较弱，此刻正是出击的最佳时机！”
尸祖颔首，周身死气凝聚成数道黑色洪流，席卷戈壁：“传我命令，幽冥鬼兵即刻集结，半月之后，兵发襄阳，覆灭大尸王朝！”
东瀛的海风渐渐远去，西域的风沙愈发狂暴。丁大材的四十二万大军带着一统东岛的威势，踏上归途；尸祖的三百万幽冥鬼兵则杀气腾腾，准备主动出击。一场关乎天下命运的终极决战，已箭在弦上，即将爆发。