当登陆舱返回绿星号时，临时净化阵的维持时间仅剩最后5分钟，外部的熵能潮汐已开始爆发，淡紫色的熵能如同潮水般冲击着光罩，光罩的表面出现大量裂纹。石心长老带领岩晶族战士，将所有星骸岩能量注入光罩，才勉强支撑到登陆舱返回。
苏瑶立刻将激活的净化母藤接入能量中枢，六文明的信物能量与星盟核心钥的能量同时注入藤蔓。淡绿色的藤蔓快速生长，顺着能量中枢蔓延至整个绿星号，甚至延伸到其他文明的星舰上，形成一道覆盖整个联盟舰队的“净化网络”。
“星盟终极净化阵预演开始！”苏瑶的声音传遍整个舰队，“净化母藤已与六文明能量连接，熵能吸收效率达到98%，足以支撑净化阵的能量消耗！预计两小时后，净化阵可正式启动，摧毁混沌重构炮！”
就在此时，绿星号的警报突然响起。赵凯的声音带着急促：“检测到大量‘熵能战舰’从深渊的另一侧驶来，它们是卡伦的残余势力，舰身覆盖着厚厚的熵能合金，目标是摧毁我们的净化网络！”
林羽看向观测窗，远处的星空中，数十艘黑色的熵能战舰正在快速靠近，舰身的炮口正凝聚着紫色的熵能炮弹。“各文明舰队，组成‘净化防御阵’！”林羽下令道，“用净化母藤的藤蔓连接所有星舰，形成一道巨大的净化屏障，吸收熵能炮弹的能量，转化为净化阵的能量！”
联盟舰队立刻行动，淡绿色的净化藤蔓在星舰之间快速生长，形成一道覆盖数百公里的屏障。熵能战舰发射的紫色炮弹击中屏障，瞬间被藤蔓吸收，转化为淡绿色的能量，注入净化母藤。藤蔓的金色光芒变得更加耀眼，星盟终极净化阵的能量储备正在快速增加。
“卡伦的残余势力，不过是在为我们的净化阵补充能量！”苏瑶的声音带着自信，净化母藤的能量储备已达到80%，“再坚持一小时，净化阵就能正式启动，到时候不仅能摧毁混沌重构炮，还能彻底净化整个熵寂深渊的熵能！”
熵能战舰见炮弹无法突破屏障，开始加速朝着联盟舰队冲来，试图用舰身撞击屏障。林羽立刻调动绿星号的灵脉主炮，将净化母藤的能量注入主炮，发射出一道巨大的“净化光束”，击中最前方的熵能战舰。战舰的熵能合金外壳瞬间被净化，舰身内部的熵能设备也随之失效，战舰化为一堆废铁，漂浮在星空中。
其他文明的舰队也纷纷效仿，用净化能量攻击熵能战舰。淡绿色的净化光束在星空中交织，形成一道美丽的光网，熵能战舰在光网中如同脆弱的玻璃，纷纷被摧毁。当最后一艘熵能战舰被净化光束击中时，净化母藤的能量储备已达到100%，星盟终极净化阵的启动条件终于满足。
“各文明舰队注意，星盟终极净化阵即将启动！”林羽的声音传遍整个宇宙，“所有人进入净化舱，启动个人净化护盾，避免被净化能量误伤！苏瑶，启动净化阵！”
苏瑶按下能量中枢的启动按钮，淡绿色的净化母藤突然爆发出耀眼的金色光芒，光芒覆盖整个熵寂深渊。混沌重构炮的炮身在光芒中开始出现裂纹，黑色的能量导管逐渐被净化，转化为淡绿色的灵脉能量；被熵能污染的星球残骸，也在光芒中恢复原本的颜色，甚至开始出现嫩绿的灵植幼苗。
当金色光芒逐渐消退时，混沌重构炮已彻底化为一堆废铁，熵寂深渊的熵能浓度恢复到正常水平，星空中的紫色逐渐被淡绿色取代，无数颗被净化的星球残骸，如同新生的星辰，在星空中闪烁。
联盟舰队的成员纷纷走出净化舱，看着眼前的景象，所有人都欢呼起来。林羽站在绿星号的舰桥，手中握着星盟核心钥，传承戒的光芒与核心钥相互呼应，投射出一段完整的星盟信息：“万年前，星盟为了阻止混沌重构炮的启动，牺牲了六文明的守护者，将卡伦封印在熵寂深渊。如今，你们完成了守护者的使命，彻底摧毁了混沌重构炮，净化了熵能威胁，宇宙的生机将得以延续。”
绿星号驶离熵寂深渊时，六文明的舰队在身后形成护卫阵型，淡绿色的净化藤蔓在星舰之间交织，形成一道美丽的光带。林羽站在观测窗前，看着手中的星盟核心钥与六块符文碎片，心中明白，第一阶段的未知星域探索已圆满结束——他们不仅摧毁了卡伦的混沌重构炮，联合了10+被侵害文明，解锁了灵植的“星际共生”能力，还揭开了万年前星盟覆灭的部分真相。
“赵凯，调整航向，返回联盟总部。”林羽的声音传遍整个舰队，“苏瑶，用净化母藤的种子净化被熵能污染的星球；各文明首领，准备召开联盟大会，制定《宇宙生机守护公约》，共同守护宇宙的生机与和平。”
绿星号的引擎爆发出淡金色的光芒，朝着联盟总部的方向驶去。身后的熵寂深渊逐渐消失在视野中，星空中的淡绿色灵植幼苗，如同新生的希望，在宇宙中绽放。林羽握紧传承戒，心中明白，虽然第一阶段的任务已完成，但“黑手线索线”的探索才刚刚开始——卡伦的可控熵能技术、万年前星盟叛逆者的完整真相、还有符文碎片中隐藏的星盟秘密，都等待着他们去揭开。而宇宙生机联盟的使命，也将从“对抗熵能威胁”，转向“守护宇宙生机，探索星盟秘密”的全新阶段。