艾登想起师父临终前空洞的眼窝，胃里一阵翻腾。原来那不是什么谋杀，而是师父自愿的牺牲。
但他犯了个错误。温特的声音突然变得扭曲，他没想到毒素会产生变异。现在整个伦敦都在感染范围内，除非...
琴声戛然而止。温特的身体开始透明化，银莲花纹路在他的皮肤下疯狂蔓延。
除非用第一个实验体的血液制作血清。温特艰难地说完，突然将小提琴砸向管风琴。
震耳欲聋的爆炸声中，艾登看到管风琴的音管里涌出无数机械蝴蝶。它们翅膀上的毒素孢子闪烁着致命的紫光，正朝着通风管道飞去。
来不及了...温特倒在地上，身体正在快速结晶化，祭坛已经启动...
艾登冲向控制台，怀表突然发出强烈的震动。表盘弹开，露出里面隐藏的微型注射器——正是影像中师父使用的那支。
用我的血...他喃喃自语，突然明白师父留给他的真正遗产。
当第一只机械蝴蝶即将飞入通风管道时，艾登将注射器刺入自己的心脏。剧痛让他几乎昏厥，但随之而来的是一种奇特的清明感——他看到了毒素在网络中的流动轨迹，看到了整个伦敦的地下管道系统，看到了每一个感染者的位置。
露西，听得到吗？他对着通讯器喊道，这次信号畅通无阻，我需要你连接到市政供水系统，把这些坐标输入主控制台...
当他报出最后一组数字时，温特已经完全晶体化的身体突然裂开。一个全息投影从中升起，显示着1947年3月15日的实验记录。
记录的最后一段是师父的留言：致我的詹姆斯：当你看到这段影像时，说明你已经准备好了。原谅我的欺骗，但这是唯一能保护你的方式。现在，去完成我未尽的使命吧。
投影消失时，整个地宫开始震动。艾登听到远处传来露西的声音：血清正在注入供水系统，感染开始消退！
他瘫坐在地上，怀表的指针终于停止了转动，永远定格在3:17。比师父死亡的时间晚了两分钟，却像是过了一个世纪。
当第一缕晨光透过穹顶的破洞照进来时，艾登看到地面上浮现出一行由晶体组成的文字：第一乐章终，第二乐章即将开启。
当伦敦的毒素危机暂时平息，艾登在整理师父的遗物时发现了一个加密的日记本。最后一页写着：如果他们找到了钟楼下的沉睡者，整个世界都将陷入永夜。
与此同时，露西的机械义肢开始接收奇怪的信号，显示王莲毒素正在泰晤士河底聚集，形成某种巨大的生物结构。而克莱尔突然失踪，只留下一张字条：我去寻找亚瑟真正的死因，勿念。
更令人不安的是，本该死去的温特出现在监控录像中，正站在大本钟的顶端俯视整个伦敦。他的手中拿着一个银色的怀表，与艾登的那只一模一样。
游戏才刚刚开始，亲爱的詹姆斯。温特的声音通过所有无线电设备传出，让我们看看，你是否比你师父做得更好。
浓雾再次笼罩伦敦，而这一次，毒素学会了思考...