当到达超级武器制造地时，他们分成两队，一队破坏武器，一队应对赶来救援的敌军。经过激烈战斗，成功炸毁超级武器。
返回后，两个宇宙为表彰万军的主角团，举办盛大庆典。万军的主角团明白，未来还有更多挑战，但只要团结一致，就能应对一切。
然而，就在庆典举行到高潮之时，警报声突然响彻整个会场。
众人惊愕之际，屏幕上显示出一艘巨大而神秘的飞船正在急速靠近。
这艘飞船散发着诡异的能量波动，不属于已知的任何一方势力。
万军的主角团立刻警惕起来，纷纷握紧武器。随着飞船的靠近，舱门缓缓打开，一道耀眼的光芒射出，从中走出一个全身笼罩在黑袍之下的身影。
“你们以为摧毁一个超级武器就万事大吉了？这不过是个开端罢了。”
黑袍人发出低沉而冰冷的声音，充满压迫感。
主角团毫不畏惧，万军站出来说道：“不管你是谁，我们既然能解决之前的危机，也不会惧怕现在的状况。”
双方剑拔弩张之时，周围的气氛紧张到了极点，一场新的战斗仿佛即将爆发，而主角团已然做好了迎接未知挑战的准备。
黑袍人冷笑一声，抬手一挥，一群外形怪异的生物瞬间出现在他身后。这些生物身形高大，皮肤长满鳞片，眼睛闪烁着凶光。“那就试试看吧。”黑袍人话音刚落，那些怪物便朝着万军的主角团冲了过来。
万军的主角团迅速散开，摆开战斗阵型。万军率先冲向最前面的一只怪物，手中武器爆发出强大的力量，直接击中怪物的胸口。
但那怪物只是晃了晃身子，又继续扑来。其他成员也遭遇同样的困境，这些怪物的防御力远超想象。
就在这时，其中一个队员，发现这些怪物的弱点在它们的眼睛，于是大声呼喊告知队友。主角团改变战术，集中攻击怪物们的眼睛。
很快，几只怪物倒下。黑袍人见状，脸色变得阴沉，他双手结印，一股黑暗力量向主角团席卷而来。
万军大喝一声，全体队员将力量汇聚在一起，形成一道护盾抵挡黑暗力量。
而后，万军带领团队向着黑袍人发起反击，准备一举击败这个新的威胁者。
万军等人的力量如同一道流星般冲向黑袍人，黑袍人却丝毫不慌，只见他身前浮现出一面黑色的屏障，轻松挡下了这一击。
黑袍人嘲讽道：“这点本事就想打败我？”随后双手一挥，更多的怪物涌了出来。此时万军注意到黑袍人的动作有些机械，像是被操控一般。
他心中一动，难道背后另有主谋？他一边战斗一边悄悄观察四周，果然发现不远处有一个隐藏的信号源。
万军示意队友继续佯攻黑袍人，自己则偷偷绕向信号源处。接近后，万军发现一个小型装置正发射着控制波。他果断毁掉装置。
瞬间，黑袍人像失去支撑一样瘫倒在地，那些怪物也停止了攻击，一脸茫然。原来黑袍人也是受害者，他本是一个探险家，被邪恶势力利用并控制。
万军的主角团决定救治黑袍人，并从他口中获取关于幕后黑手的线索。
他们知道，真正的危机还没有解除，只有找到幕后黑手，才能彻底保障两个宇宙的和平。