他们拘泥于眼前的苟且安稳，只知道用迁移边境地区的方法来躲避贼寇的祸患，结果使得贼寇的势力愈发猖獗，而百姓的生活也因此变得颠沛流离。
过去的事情处理不当，灾祸一直延续到现在，给朝廷带来了极大的忧虑。”
最后，施琅在关系到国家和民族根本利益的台湾弃留问题上，态度异常坚决地得出结论：台湾“如果放弃，必然会酿成大祸；如果保留，确能够永远巩固边疆。”
对于议政王大臣的争议不断，康熙正月每日都在思考台湾的弃留。
正月十五，康熙亲自召见郑克爽、冯锡范、刘国轩。
康熙皇帝对郑克爽、冯锡范和刘国轩等人进行了封赐，赐予郑克爽公爵之位，冯锡范和刘国轩则被封为伯爵。
不仅如此，他们还被纳入汉军上三旗，并得到了房屋和土地等赏赐。
施琅兑现了自己的诺言，他向康熙上书保举刘国轩，称：
“经过仔细观察台湾的港道，发现其迂回曲折，地势狭窄，波涛汹涌湍急，可谓是极其险峻和坚固的地方，似乎并非容易以武力夺取胜利的地方。
然而，刘国轩毅然决然地决定将生死托付给朝廷，以免给百姓带来生灵涂炭的灾难，极力主张归顺朝廷，最终使得清军不费一兵一卒便得到了整个台湾，他的功劳不可小觑。”
康熙皇帝对刘国轩的表现十分赞赏，于是任命他为直隶天津总兵。
在刘国轩上任之前，康熙皇帝亲自召见了他，并对他说：
“台湾地区与朝廷隔绝六十多年，你一直心怀忠诚。由于施琅率军征讨，你率先归顺朝廷，因此特别授予你总兵官的职位，以表示对你的优待和眷顾。不过，天津这个地方与其他偏远省份有所不同，你需要格外留意安抚百姓，使士兵和民众相安无事，盗贼绝迹。”
随后赐给刘国轩白金二百两，表里绸缎各十匹，御马一匹。
康熙二十三年正月二十七日。
在康熙皇帝的坚持和果断决策下，力排众议，在台湾设立一府三县，并设置巡道一员进行管辖。
这一府三县隶属于福建省，其中府名为台湾，其附郭县名为台湾县，南部为凤山县，北部则是诸罗县，均由台厦兵备道分别统辖。
与此同时，康熙皇帝还在台湾地区设立了总兵官一员、副将二员，并配备八千名士兵，分为水陆八营。
此外，在澎湖也设立了副将一员，统领二千名士兵，分为二营，每个营都设有游击、守备、千总、把总等各级官员。
康熙皇帝任命参领杨文魁担任首任福建台湾总兵官。
在杨文魁上任前向康熙皇帝辞别时，康熙皇帝特意召见他，并当面嘱咐道：
“台湾地处遥远的海滨，刚刚平定不久，那里新归附的兵丁以及当地的土人、黑人等，种类繁多。你到任之后，务必采取合适的方法进行安抚和治理。对于那些需要用威严来震慑的人，就用威严来对待他们；对于那些需要用恩德来感化的人，就用恩德来关怀他们。总之，要做到既有利于军队，又有利于百姓，使海外地区保持安宁。”
康熙皇帝进一步告诫杨文魁：“台湾以海洋为财富之源，海上的商船和商贩必然很多。你必须严格约束部下，绝不能因为贪图私利而引发事端。”
至此，大清一统台湾，施琅立了大功、姚启圣被气死。
康熙对于台湾的政策公布，明珠呵呵一笑：“皇上圣明！”
康熙瞅着明珠的笑意问道：“听说，纳兰性德回来了？”