晋纪三十八
公元411年，春季，正月己未日，刘裕回到建康。
同时，后秦广平公姚弼受到后秦王姚兴的宠爱，担任雍州刺史，镇守安定。姜纪谄媚依附姚弼，劝说姚弼结交姚兴身边的人，谋求进入朝廷任职。姚兴征召姚弼担任尚书令、侍中、大将军。姚弼于是竭力结交朝廷官员，谋取名声权势，以此排挤太子；因此，国民都非常厌恶他。恰逢姚兴因西北地区多有叛乱，想派重要将领去镇守安抚；陇东太守郭播请求让姚弼出京镇守，但是姚兴没有同意，于是任命太常索棱为太尉、兼任陇西内史，派他招抚西秦。西秦王乞伏乾归派遣使者送回此前掳掠的后秦地方官员，认罪请求归降。姚兴派鸿胪卿授予乞伏乾归都督陇西、岭北、匈奴、杂胡诸军事、征西大将军、河州牧、单于、河南王等官职，任命其太子乞伏炽磐为镇西将军、左贤王、平昌公。
姚兴命令大臣们搜寻举荐贤才。右仆射梁喜说：“我多次接受诏令却没找到合适的人选，可说是当今世上缺乏人才。”姚兴说：“自古以来帝王兴起，从未从过去的人中选取宰相、等待未来的人充当将领。根据时势任用人才，都能实现天下太平。你自己识别人才、选拔人才不明，怎能远远地诬陷天下没有贤才呢！”这话听的大臣们都很高兴。
此时，后秦的姚详驻守杏城，受到夏王刘勃勃的逼迫，向南逃奔大苏；刘勃勃派平东将军鹿弈干追击，斩杀姚详，并将其部众全部俘虏。就勃勃向南进攻安定，在青石北原打败尚书杨佛嵩，降服其部众四万五千人；接着进攻东乡，成功攻克该城，并将三千多户百姓迁徙到贰城。后秦镇北参军王买德逃奔夏国，刘勃勃向他询问消灭后秦的策略，王买德说：“后秦德行虽已衰败，但藩镇还很稳固，希望暂且积蓄力量等待时机。”刘勃勃任命王买德为军师中郎将。后秦王姚兴派卫大将军常山公姚显前去接应姚详，但没能赶上，于是驻守杏城。
刘籓率领孟怀玉等将领追击卢循到岭南，二月壬午日，孟怀玉攻克始兴，斩杀徐道覆。
河南王乞伏乾归将鲜卑仆浑部三千多户迁徙到度坚城，任命儿子乞伏敕勃为秦兴太守，镇守该城。
此时，焦朗仍占据姑臧，沮渠蒙逊攻克该城，擒获焦朗后宽恕了他；任命弟弟沮渠挐为秦州刺史，镇守姑臧。随后沮渠蒙逊讨伐南凉，包围了乐都。围攻三十天却未能攻克；南凉王秃发傉檀把儿子秃发安周当作人质，沮渠蒙逊这才撤兵。
吐谷浑可汗树洛干讨伐南凉，打败南凉太子秃发虎台。
南凉王秃发傉檀想再次讨伐沮渠蒙逊，邯川护军孟恺劝谏说：“沮渠蒙逊刚吞并姑臧，气势正盛，不能进攻他。”秃发傉檀不听，兵分五路一同进军，抵达番禾、苕藋，掳掠五千多户百姓后返回。将军屈右说：“如今已经获利，应当加速撤军，尽早越过险要地带。沮渠蒙逊善于用兵，若他派轻装部队突然赶到，外部有强敌逼近，内部被掳来的百姓反叛，这是危险的做法。”卫尉伊力延说：“他们是步兵，我们是骑兵，势必追不上我们。现在加速返回会显得我们软弱，而且要丢弃物资财物，不是好计策。”不久，天气出现昏暗的大雾和大风暴雨，沮渠蒙逊的军队大规模赶到，秃发傉檀战败逃走。沮渠蒙逊进军包围乐都，秃发傉檀环城固守，把儿子秃发染干当作人质请求讲和，沮渠蒙逊这才撤兵。这儿子多了是真有好处。
三月，刘裕开始接受太尉、中书监的官职，任命刘穆之为太尉司马，陈郡人殷景仁为行参军。刘裕问刘穆之：“孟昶的属官中谁能进入我的府中任职？”刘穆之推荐前建威中兵参军谢晦。谢晦是谢安的哥哥谢据的曾孙，刘裕当即任命他为参军。刘裕曾审理囚犯，当天早晨，刑狱参军生病，便让谢晦代替；谢晦在车中翻阅一遍审讯记录，很快就作出判决。相府事务繁多，监狱中关押的囚犯积压众多，谢晦随问随答，从未出现差错；刘裕因此认为他有奇才，当天就任命他为刑狱贼曹。谢晦容貌俊美，善于言谈说笑，学识渊博且通晓事理，刘裕对他深加赏识喜爱。
卢循沿途招集士兵，抵达番禺，随即包围该城。孙处据城坚守二十多天。沈田子对刘籓说：“番禺城虽险要坚固，却是叛军的老巢；如今卢循围攻它，或许会发生内部叛乱。而且孙季高（孙处字季高）兵力薄弱，不能长期坚守，若让叛军重新占据广州，其凶势会再次振作。”夏季，四月，沈田子领兵援救番禺，进攻卢循，打败叛军，斩杀一万多人。卢循逃走，沈田子与孙处一同追击，又在危梧、郁林、宁浦打败卢循。恰逢孙处生病，无法继续进军，卢循才有了机会逃奔交州。
起初，九真太守李逊发动叛乱，交州刺史交趾人杜瑗讨伐并斩杀了他。杜瑗去世后，朝廷任命他的儿子杜慧度为交州刺史。诏书还未抵达，卢循就攻占了合浦，径直向交州进军；杜慧度率领州府文武官员在石碕抵抗卢循，打败叛军，卢循剩余的部众还有三千人，李逊的残余党羽李脱等人聚集俚獠族五千多人响应卢循。庚子日，卢循清晨抵达龙编南津；杜慧度拿出全部家财赏赐士兵，与卢循交战，投掷雉尾炬焚烧叛军船只，另派步兵在两岸射箭，卢循的船只全部着火，部众大败。卢循知道自己无法逃脱，就先毒死妻子儿女，召来妓妾问道：“谁能随我去死？”妓妾们大多说：“雀鼠尚且贪生，去死实在困难。”有人说：“您尚且要去死，我怎能愿意活着！”卢循于是杀掉所有不愿去死的妓妾，随后自己投水自杀。杜慧度捞起他的尸体斩首，连同他们父子以及李脱等人的首级，装在七个盒子里送往建康。
起初，刘毅在京口时生活贫困，与熟人在东堂射箭。庾悦当时任司徒右长史，后来到达，抢占了东堂；众人都躲避他，只有刘毅不离开。庾悦的酒菜十分丰盛，却不分给刘毅；刘毅向庾悦索要烤鹅，庾悦发怒不给，刘毅因此对他怀恨在心。到这时，刘毅请求兼任都督江州，诏令准许，于是他上奏说：“江州是内地，应以治理百姓为职责，不应设置军府消耗民力，应当撤销军府，将治所迁到豫章；而寻阳与蛮族地区接壤，可从州府调一千士兵协助郡中防守。”于是朝廷解除庾悦的都督、将军官职，让他以刺史身份镇守豫章。刘毅派亲信将领赵恢率领一千士兵驻守寻阳；庾悦军府的三千名文武官员全部归入刘毅的军府，刘毅对庾悦的文书传唤十分严厉。庾悦既愤怒又恐惧，抵达豫章后，背上毒疮发作而死。
河南王乞伏乾归将羌人句岂等部众五千多户迁徙到叠兰城，任命侄子乞伏阿柴为兴国太守，镇守该城。五月，又任命儿子乞伏木栾干为武威太守，镇守嵻良城。
丁卯日，北魏国主拓跋嗣拜谒金陵，山阳侯奚斤留守。昌黎王慕容伯儿谋反；己巳日，奚斤将他和他的党羽逮捕斩杀。
秋季，七月，北燕王冯跋任命太子冯永兼任大单于，设置四辅官。柔然可汗斛律派遣使者向北燕王献上三千匹马，请求娶冯跋的女儿乐浪公主。冯跋命令大臣们商议此事。辽西公冯素弗说：“前代都把宗室女子嫁给四方少数民族，应当把妃嫔的女儿许配给他，乐浪公主不应下嫁给非汉族的外族。”冯跋说：“我正推行对不同民族的信任政策，怎能欺骗他们呢！”于是将乐浪公主嫁给斛律。
冯跋勤于处理政事，鼓励督促农桑生产，减免徭役，减轻赋税；每次任命地方官员，必定亲自召见，询问治理政事的关键，以此观察他们的能力。燕国人对此十分满意。
这时，河南王乞伏乾归派遣平昌公乞伏炽磐以及中军将军乞伏审虔（乞伏乾归的儿子）讨伐南凉。八月，乞伏炽磐的军队渡过黄河，南凉王秃发傉檀派太子秃发虎台在岭南迎战。南凉军队战败，乞伏炽磐掳掠十几万头牛马后返回。
沮渠蒙逊率领轻骑兵袭击西凉，西凉公李暠说：“用兵有不用交战就打败敌人的方法，那就是挫伤他们的锐气。沮渠蒙逊刚与我们结盟，却突然来袭击我们，我们关闭城门不与他交战，等他锐气耗尽再进攻，没有不能攻克的。”不久，沮渠蒙逊粮草耗尽撤兵，李暠派世子李歆率领七千骑兵截击，沮渠蒙逊大败，西凉俘获其将领沮渠百年。
河南王乞伏乾归在柏阳堡进攻后秦略阳太守姚于，攻克该堡。冬季，十一月，又在水洛城进攻南平太守王憬，再次攻克，将三千多户百姓迁徙到谭郊。派遣乞伏审虔率领二万部众在谭郊筑城。十二月，西羌首领彭利发攻占枹罕，自称大将军、河州牧，乞伏乾归讨伐他，但没能攻克。
这一年，并州刺史刘道怜调任北徐刺史，将治所迁到彭城。
到了公元412年，春季，正月，河南王乞伏乾归再次讨伐彭利发，抵达奴葵谷。彭利发抛下部众向南逃跑，乞伏乾归派振威将军乞伏公府追击到清水，将他斩杀，又收服羌人部落一万三千户，任命乞伏审虔为河州刺史，镇守枹罕，自己率军返回。
二月丙子日，朝廷任命吴兴太守孔靖为尚书右仆射。河南王乞伏乾归迁都到谭郊，命令平昌公乞伏炽磐镇守苑川。乞伏乾归在赤水进攻吐谷浑的阿若干，并降服了他。
夏季四月，刘道规因患病请求回京，朝廷准许。刘道规在荆州任职多年，对百姓秋毫无犯。等到回京时，府库中的财物、帷幕等，都完好如初。有两名随身卫兵擅自把席子搬到船上，刘道规就将他们在街市上斩首示众。
随后，朝廷任命后将军、豫州刺史刘毅为卫将军，都督荆、宁、秦、雍四州诸军事，兼任荆州刺史。刘毅对左卫将军刘敬宣说：“我愧任西方的要职，想委屈你担任南蛮长史，你愿意辅佐我吗？”刘敬宣感到畏惧，就把这件事告诉了太尉刘裕。刘裕笑着说：“只要让你老兄平安无事，一定不必多虑。”
刘毅生性刚愎自用，自认为当年举义讨伐桓玄的功劳与刘裕相当，因而居功自傲。虽然在权力事务上表面推让刘裕，内心却不服气。等到担任地方重镇长官后，常常因志向不得施展而闷闷不乐。刘裕每次都对他温和顺从，这使得刘毅更加骄横放纵，他曾说：“遗憾的是没赶上楚汉相争的时代，不能与刘邦、项羽争夺中原！”等到在桑落洲战败，他知道人心已离他而去，便越发愤懑激昂。刘裕一向没有学识，而刘毅却颇通文墨，因此朝廷中有名望的士人大多归附刘毅，他与尚书仆射谢混、丹阳尹郗僧施来往密切，相互依托勾结。郗僧施是郗超的侄子。刘毅占据长江上游地区后，暗中有图谋刘裕的打算，请求兼任都督交、广二州军事，刘裕答应了他。刘毅又上奏请求任命郗僧施为南蛮校尉、后军司马，毛修之为南郡太守，刘裕也一一准许，同时任命刘穆之代替郗僧施担任丹阳尹。刘毅上表请求到京口拜祭祖先陵墓，刘裕前往倪塘与他相会。宁远将军胡籓对刘裕说：“您认为刘卫军（刘毅）最终能甘心在您之下吗？”刘裕沉默许久，问道：“你认为会怎样？”胡籓说：“统领百万大军，攻必克、战必胜，刘毅原本因此敬畏您。但说到博览典籍、谈诗咏文，他自认为是豪杰；因此士大夫和白面书生都聚集到他身边。恐怕他最终不会在您之下，不如趁这次相会除掉他。”刘裕说：“我与刘毅都有攻克强敌、恢复社稷的功劳，他的过错还没明显暴露，不能自相残杀。”
乞伏炽磐在白土进攻南凉的三河太守吴阴，攻克该城，任命乞伏出累代替吴阴担任太守。
六月，乞伏公府杀害河南王乞伏乾归，同时杀死他的十几个儿子，逃到大夏据守。平昌公乞伏炽磐派他的弟弟广武将军乞伏智达、扬武将军乞伏木弈干率领三千骑兵讨伐乞伏公府；任命另一个弟弟乞伏昙达为镇京将军，镇守谭郊，骁骑将军娄机镇守苑川。乞伏炽磐率领文武官员及百姓二万多户迁到枹罕。
后秦很多人劝说后秦王姚兴趁乱攻取乞伏炽磐，姚兴说：“讨伐正在办丧事的国家，不合礼仪。”夏王刘勃勃想进攻乞伏炽磐，军师中郎将王买德劝谏说：“乞伏炽磐是我们的盟国，如今他遭遇家丧战乱，我们不能体恤帮助，反而依仗兵力去讨伐他，就连普通人都认为这种事可耻，何况帝王呢！”刘勃勃于是停止行动。
闰六月庚子日，南郡烈武公刘道规去世。
秋季七月己巳朔日（初一），北魏国主拓跋嗣向东巡视，设置四厢大将、十二小将；任命山阳侯奚斤、元城侯拓跋屈分别担任左、右丞相。庚寅日，拓跋嗣抵达濡源，巡视西北各部落。
乞伏智达等人在大夏打败乞伏公府，乞伏公府逃到叠兰城，投靠他的弟弟乞伏阿柴。乞伏智达等人攻克叠兰城，斩杀乞伏阿柴父子五人。乞伏公府又逃到嵻良南山，被追兵抓获，连同他的四个儿子一起，在谭郊被车裂处死。
八月，乞伏炽磐自称大将军、河南王，宣布大赦，改年号为永康；将乞伏乾归安葬在枹罕，谥号为武元王，庙号高祖。接着，又发生了一件大事，东晋皇后王氏去世了。
庚戌日，北魏国主拓跋嗣返回平城。
九月，河南王乞伏炽磐任命尚书令武始人翟勍为相国，侍中、太子詹事赵景为御史大夫；撤销尚书令、仆射、尚书六卿、侍中等官职。
癸酉日，东晋将僖皇后安葬在休平陵。
刘毅自从抵达江陵后，便多次更换当地的地方官员，还擅自抽调豫州的文武官员、江州的一万多兵力跟随自己。恰逢刘毅病重，郗僧施等人担心刘毅死后，他们的党羽会陷入危境，于是劝说刘毅请求让堂弟兖州刺史刘籓来担任副手，太尉刘裕假装同意。刘籓从广陵入朝，己卯日，刘裕以诏书列举刘毅的罪状，称他与刘籓、谢混共同谋划叛乱，将刘籓、谢混逮捕并赐死。起初，谢混与刘毅关系亲密，谢混的堂兄谢澹常常为此担忧，逐渐与谢混疏远，他对弟弟谢璞及侄子谢瞻说：“谢益寿（谢混字益寿）这种性格，最终会使家族破败。”谢澹是谢安的孙子。
庚辰日，朝廷宣布大赦，任命前会稽内史司马休之为都督荆、雍、梁、秦、宁、益六州诸军事、荆州刺史；北徐州刺史刘道怜为兖、青二州刺史，镇守京口。任命豫州刺史诸葛长民监管太尉留府事务。刘裕担心诸葛长民难以独自胜任，于是加授刘穆之为建武将军，配置属官，调拨物资兵力来防备他。
壬午日，刘裕率领各路军队从建康出发，参军王镇恶请求拨给他一百艘战船担任先锋。丙申日，大军抵达姑孰，刘裕任命王镇恶为振武将军，与龙骧将军蒯恩率领一百艘战船先行出发。刘裕告诫他们说：“如果敌军可以攻击，就发起进攻；如果不能攻击，就烧毁他们的船舰，停在水边等待我大军到来。”于是王镇恶日夜兼程进军，对外宣称是刘兖州（刘籓）西上。
冬季十月己未日，王镇恶抵达豫章口，这里距离江陵城二十里，将士们弃船登陆步行前进。蒯恩的部队在前面开路，王镇恶的部队紧随其后。每艘船上只留下一两个人，在岸边对着战船竖起六七面旗帜，旗帜下放置战鼓，告诉留下的人：“估计我们快到江陵城时，就擂鼓助威，制造后面有大军赶来的声势。”又分派士兵去烧毁江津的敌船。王镇恶径直进军袭击江陵城，对前面的士兵说：“如果有人盘问，就说刘兖州到了。”江津的守军及百姓都安然无事，没有怀疑。在距离江陵城五六里的地方，遇到刘毅的部将朱显之正要去江津，朱显之问：“刘兖州在哪里？”士兵回答：“在后面。”朱显之到队伍后面，没看到刘籓，却看到士兵们扛着盾牌等作战器械，又望见江津的船舰已被烧毁，鼓声震天，知道来的不是刘籓，便骑马飞奔回去报告刘毅，并下令关闭所有城门。王镇恶也率军疾驰前进，城门还没来得及关闭，士兵们就趁机冲入城中。卫军长史谢纯正进去拜见刘毅，出来时听说敌军到来，手下人想拉他坐车逃走。谢纯呵斥道：“我是人家的属官，往哪里逃！”于是骑马返回府中。谢纯是谢安的哥哥谢据的孙子。王镇恶与城内守军交战，同时进攻刘毅的官署。从午饭时间一直打到傍晚，城内守军溃败逃散。王镇恶在官署的城墙上凿出洞口攻入，派人把诏书、赦免令以及刘裕的亲笔信给刘毅看，刘毅全都烧掉不看，与司马毛修之等人率领士兵奋力抵抗。城内士兵起初还不信刘裕亲自前来，后来那些跟随刘毅从东方来的士兵，与朝廷军队中有很多是表亲，一边交战一边交谈，知道刘裕确实亲自来了，人心离散恐惧。到了夜里，刘毅办公处的士兵都逃散了，朝廷军队斩杀了刘毅的勇将赵蔡，刘毅身边的士兵仍关闭东、西阁抵抗。王镇恶担心在黑暗中自相残杀，于是率军退出，包围官署，只留下南面的通道。刘毅担心南面有伏兵，半夜时分，率领身边三百多名士兵从北门突围逃出。毛修之对谢纯说：“您只管跟我走。”谢纯不肯，最终被人杀死。刘毅连夜逃到牛牧佛寺。当初，桓蔚战败时，曾逃到牛牧佛寺投奔僧人昌，昌把他藏了起来，刘毅却杀了昌。到这时，寺里的僧人拒绝收留刘毅，说：“过去我们的师父收留桓蔚，却被刘卫军杀死，现在实在不敢再收留外人了。”刘毅叹息道：“自己制定的规矩，最终却害了自己，竟然到了这种地步！”于是上吊自杀。第二天，当地百姓把这件事报告给朝廷军队，朝廷军队便在街市上砍下刘毅的头颅，他的子侄也全部被处死。刘毅的哥哥刘模逃到襄阳，鲁宗之斩杀刘模，把他的首级送往朝廷。
起初，刘毅的叔父刘镇之在京口闲居，不接受朝廷征召，他常对刘毅、刘籓说：“你们的才能足以实现志向，但恐怕不会长久。我不向你们谋求财富官位，也不会和你们一起承受灾祸。”每次看到刘毅、刘籓带着随从来到家门口，就辱骂他们，刘毅对他十分敬畏，每次到他家门口几百步远的地方，就把仪仗卫兵全部撤走，只和几个平民打扮的人一起进去。等到刘毅死后，太尉刘裕上奏征召刘镇之为散骑常侍、光禄大夫，刘镇之坚决推辞不去。
这时，仇池公杨盛背叛后秦，侵犯骚扰祁山。秦王姚兴派建威将军赵琨为前锋，立节将军姚伯寿随后跟进，前将军姚恢从鹫峡出兵，秦州刺史姚暠从羊头峡出兵，右卫将军胡翼度从汧城出兵，共同讨伐杨盛。姚兴亲自从雍城出发前往前线，与各路将领在陇口会合。
天水太守王松匆对赵琨说：“先帝（姚苌）神机妙算，无往不利，徐洛生凭借勇武辅佐先帝，两次进攻仇池，都无功而返；不是杨氏智勇双全难以战胜，只是因为仇池地势险要坚固罢了。如今凭借赵琨您的部众、您的威望，与先帝时期相比，实在难以成功。您清楚当地的地形险阻，为什么不向朝廷上奏说明呢？”赵琨不听。杨盛率领部众与赵琨对峙，姚伯寿畏惧怯懦不敢前进，赵琨兵力单薄，难以抵挡，被杨盛打败。姚兴斩杀姚伯寿后撤军。
随后，姚兴任命杨佛嵩为雍州刺史，率领岭北的现有兵力进攻夏国。杨佛嵩出发几天后，姚兴对大臣们说：“杨佛嵩每次遇到敌人，就会奋勇得无法自控，我常限制他的兵力不超过五千人。如今他率领的兵力太多，遇到敌人必定失败，现在已经走远了，追也追不上，该怎么办呢？”随后，杨佛嵩与夏王赫连勃勃交战，果然战败了，自己更是被赫连勃勃擒获，最终被扼断喉咙而死。
接着，后秦册立昭仪齐氏为皇后。
沮渠蒙逊迁都到姑臧。
十一月己卯日，太尉刘裕抵达江陵，杀死郗僧施。起初，毛修之虽然是刘毅的属官，但一向主动与刘裕结交，因此刘裕特别宽恕了他。朝廷赐给王镇恶汉寿子的爵位。刘裕问刘毅府中的咨议参军申永：“现在应该采取什么措施？”申永说：“消除过去的怨恨，加倍施加恩惠，按照门第等级任用人才，提拔有才能的人，这样就可以了。”刘裕采纳了他的建议，下令减轻赋税徭役，赦免罪犯，以礼征召名士，荆州百姓十分高兴。
诸葛长民骄横放纵、贪婪奢侈，所作所为大多违法，成为百姓的祸患，他常常担心太尉刘裕查办他。等到刘毅被诛杀后，诸葛长民对亲信说：“‘当年刘邦醢杀彭越，今年又杀韩信。’灾祸就要轮到我了！”于是他屏退随从，问刘穆之：“外面传言纷纷，都说太尉对我不满，为什么会这样？”刘穆之说：“太尉逆流远征，把老母亲、幼子托付给您。如果您有一丝一毫的不可靠，他怎么会这样做呢！”诸葛长民的心情才稍微安定。
诸葛长民的弟弟辅国大将军诸葛黎民劝说诸葛长民：“刘氏灭亡，也是诸葛氏的祸患，应该趁刘裕还没回来，图谋除掉他。”诸葛长民犹豫不决，没有行动，不久叹息道：“贫贱时常常渴望富贵，富贵后却必定面临危险。现在想做回丹徒的平民，还能办到吗！”于是他写信给冀州刺史刘敬宣，说：“刘盘龙（刘毅小字盘龙）凶狠专横，自取灭亡。异端势力即将铲除，天下将要太平，富贵之事，我与你共同享有。”刘敬宣回信说：“我从义熙年间以来，惭愧地担任过三州刺史、七郡太守，常常担心福分过头会引发灾祸，想着避开满盈、保持谦逊。富贵的事，我不敢担当。”并且派人把信呈给刘裕，刘裕说：“阿寿（刘敬宣小字阿寿）确实没有辜负我。”
刘穆之担心诸葛长民发动叛乱，便屏退随从问太尉行参军东海人何承天：“太尉这次出征能成功吗？”何承天说：“荆州的事不用担心不能及时解决，不过还有一个顾虑。太尉当年从左里返回石头城时，显得很随意；这次回来，应该更加谨慎。”刘穆之说：“不是你，我听不到这样的话。”
刘裕在江陵时，辅国将军王诞向刘裕请求先返回建康，刘裕说：“诸葛长民似乎有疑心，你怎么能轻易回去！”王诞说：“诸葛长民知道我受到您的重视，现在我轻装独自返回，他必定会认为没有危险，这样才能稍微安定他的心思。”刘裕笑着说：“你的勇气超过孟贲、夏育了。”于是同意他先回去。
此时，沮渠蒙逊即河西王位，宣布大赦，改年号为玄始，仿照凉王吕光担任三河王时的制度设置官员。
随后，太尉刘裕谋划讨伐蜀地，挑选统帅时难以找到合适的人选。他认为西阳太守朱龄石既有军事才能，又熟悉行政事务，想任用他。众人都认为朱龄石资历名望还浅，难以担当重任，刘裕不听。十二月，刘裕任命朱龄石为益州刺史，率领宁朔将军臧熹、河间太守蒯恩、下邳太守刘钟等人讨伐蜀地，调拨大军的一半，共二万人配属给他。臧熹是刘裕的妻弟，职位在朱龄石之上，却也归朱龄石统领。
刘裕与朱龄石秘密商议进军策略，说：“刘敬宣往年从黄虎出兵讨伐蜀地，无功而返。敌军认为我们这次应该从外水（岷江）进军，却会预料我们出其不意仍从内水（涪江）前来。这样一来，他们必定会用重兵把守涪城，防备内水方向。如果我们向黄虎进军，正好落入他们的圈套。现在派大部队从外水攻取成都，派疑兵从内水出击，这是制服敌人的奇计。”但又担心这个计划提前泄露，让敌军察觉虚实，于是另外写了一封密信封好交给朱龄石，在信封边上注明：“到白帝城再打开。”各路军队虽然出发了，却不知道具体的部署。
毛修之坚决请求随军讨伐蜀地，刘裕担心毛修之到蜀地后，必定会大肆诛杀，而蜀地百姓与毛氏有旧怨，也会拼死抵抗，于是没有同意。
随后，朝廷从荆州分出十个郡，设置湘州。
朝廷又加授太尉刘裕为太傅、扬州牧。
丁巳日，北魏国主拓跋嗣向北巡视，抵达长城后返回。
到了公元413年，春季，二月庚戌日，北魏国主拓跋嗣前往高柳川。甲寅日，返回皇宫。
同时，太尉刘裕从江陵东归，连续不断地派遣运输物资的队伍兼程赶路，预先确定了到达的日期，却常常故意滞留不前进。诸葛长民与朝廷大臣们连日在新亭等候，总是错过约定的时间。乙丑日（月末），刘裕乘坐轻舟径直前进，暗中回到东府。三月丙寅朔日（初一）清晨，诸葛长民得知消息，惊慌地赶往东府门口。刘裕在帐幔中埋伏了勇士丁旿，然后请诸葛长民屏退随从，两人单独交谈，把平生没说尽的话都讲了出来，诸葛长民十分高兴。这时丁旿从帐幔后走出，在座位上扭杀了诸葛长民，随后用车子把尸体送到廷尉府。刘裕又逮捕了诸葛长民的弟弟诸葛黎民，诸葛黎民一向勇猛，与士兵格斗后被杀。同时被杀的还有诸葛长民的幼弟、大司马参军诸葛幼民，以及堂弟、宁朔将军诸葛秀之。庚午日，后秦王姚兴派遣使者到北魏建立友好关系。
太尉刘裕上奏表说：“大司马桓温认为‘百姓没有固定的户籍，对治理危害极大’，于是推行《庚戌》土断法来统一户籍和田业。从此财富充实、国家富足，实在是得益于这项制度。从那时到现在，土断法逐渐废弛；请求重新推行以前的制度。”于是朝廷按照地域重新划分户籍，只有居住在晋陵的徐、兖、青三州百姓，不在土断之列；许多流动人口聚居的郡县大多被合并撤销。