人口暴增，原有的粗放式管理便不再适用。王也雷厉风行，开始着手构建完善的管理架构。
丹堂：任命一位原南宫家投靠过来的、精通药理的金丹客卿为暂代堂主，集中宗门内所有有炼丹天赋的弟子，统一提供丹方、药材，量化任务，开始大规模炼制辟谷丹、聚气丹、疗伤药等基础丹药，以满足日益增长的弟子需求，并开始尝试炼制更高阶的丹药。王也偶尔会亲自讲解《无上天元心法》中衍生出的部分炼丹精要，令丹堂弟子受益匪浅。
器堂：由一位精通炼器术的散修长老负责。整合新附庸家族带来的炼器师，收集材料，开始批量炼制制式飞剑、法袍、储物袋等基础法器。王也则将得自死亡谷、始皇陵的一些残缺炼器法门简化后传授下去，提升元初门法器的整体品质。那截古战矛碎片和真龙逆鳞也被送入器堂深处，作为镇堂之宝和研究对象。
刑堂：此堂至关重要，王也亲自任命性格刚直、铁面无私的石龙兼任堂主。挑选修为扎实、忠心耿耿的弟子入堂，负责监察门规执行，惩处违纪弟子，巡视宗门产业，内部肃清。王也赐下镇魂镜的仿制品（正品在温养恢复）和部分权限，赋予刑堂极大的权柄，确保宗门法度森严，赏罚分明。
外事堂：由长袖善舞、心思缜密的陈天南负责。负责对外交流、情报收集、与其他势力洽谈合作、管理宗门世俗产业等。议会成立后，外事堂的工作变得异常繁忙，需要与各方势力对接，处理越来越多的往来事务。
传功堂：王也亲自掌管核心，并设数位长老辅助。负责管理宗门功法秘籍，定期开坛讲法，考核弟子修为进境，因材施教。王也开始系统性地整理自身所学，以《无上天元心法》总纲为核心，结合从蜀山、死亡谷、始皇陵等处获得的诸多功法秘术，去芜存菁，开始构建元初门独有的、从炼气到元婴的初步传承体系。虽然最高深的核心依旧只有他亲传弟子方能修炼，但基础部分已远超许多小门派的镇派功法。
此外，还设立了杂务堂负责日常后勤、灵植堂负责管理药圃、御兽堂负责照料收服的几只护山灵兽（包括那头蛟龙后裔）等。
各司其职，条理分明。
王也更是亲自出手，引动地脉，结合阵法，在宗门内开辟出“初级修炼区”、“中级修炼区”、“核心修炼区”以及“闭关静室”，不同区域的灵气浓度不同，弟子需凭贡献度换取修炼时间，极大地激励了门人的积极性。
一系列组合拳下来，整个元初门风气焕然一新，一扫之前的松散和懵懂，变得井然有序，充满活力。弟子们有了明确的上升通道和宗门归属感，修炼热情空前高涨。
虽然整体实力与顶尖势力仍有差距，但一个组织严密、架构清晰、潜力无穷的新兴宗门，已然初具雏形。
王也坐于殿中，神念扫过宗门内辛勤修炼、各司其职的门人弟子，感受着那蓬勃发展的朝气，微微颔首。
内部初步整合完毕，根基渐稳。
接下来，便是要将目光投向那议会公约中所提及的……未知的秘境与资源了。
唯有不断获取资源，方能支撑宗门持续发展，在这大世之中真正站稳脚跟。