大明五年（公元461年，辛丑年）
春天正月戊午初一，大臣们上朝给皇上拜年。雪花落在太宰义恭衣服上，是六边形的，义恭赶紧上奏说这是祥瑞，皇上可高兴了。义恭知道皇上这人猜忌心强又暴躁，怕自己容身不了，所以平时说话特别谦卑，态度也很恭敬，各种讨好皇上。就因为这样，在皇上在位期间，他一直没惹上灾祸。
二月辛卯，北魏皇帝去中山；丙午，到了邺城，接着又去信都。
三月，刘宋派使者去北魏。
北魏皇帝征调并州、肆州的五千老百姓，去修河西打猎的道路；辛巳，回到平城。
夏天四月癸巳，把西阳王刘子尚改封为豫章王。
庚子，皇上下诏开始修建明堂，直接在丙、己方位建大殿，规制和太庙一样，就只有十二间这点不同。
雍州刺史海陵王刘休茂，才十七岁，司马新野的庾深之处理州府事务。刘休茂性子急，想自己做主处理事情，庾深之和主帅老是拦着他，他心里就老不痛快。他身边有个叫张伯超的很受宠，但这人坏事干了不少，主帅经常斥责他。张伯超害怕了，就跟刘休茂说：“主帅偷偷写您的过失，打算报告给皇上，这样下去恐怕没好果子吃。”刘休茂问：“那咋办？”张伯超说：“只能把行事和主帅杀了，起兵自卫。这儿离都城好几千里，就算大事办不成，逃到北魏那边也能当个王。”刘休茂就听了他的。
丙午夜，刘休茂和张伯超等人带着夹毂队，在城里把典签杨庆杀了，出了金城，又杀了庾深之和典签戴双。然后召集士兵，竖起军旗，发布檄文，让手下官员推举自己为车骑大将军、开府仪同三司，加黄钺。侍读博士荀诜劝他别这样，刘休茂把荀诜也杀了。张伯超独揽军政大权，想杀谁就杀谁。刘休茂身边的曹万期冲出来砍刘休茂，没成功，自己死了。
刘休茂出城去军营，咨议参军沈畅之等人带着人关起城门不让他进来。刘休茂赶紧往回跑，进不去城。义成太守薛继考帮着刘休茂攻城，把城攻下来了，杀了沈畅之等几十个参与拒城的人。当天，参军尹玄庆又起兵攻打刘休茂，把他活捉了，然后砍了头，刘休茂的老妈和老婆都自杀了，他的同党也都被处死。城里乱成一团，没人管事儿。中兵参军刘恭之，是刘秀之的弟弟，大家就一起推举他处理州府事务。薛继考带兵威胁刘恭之，让他写奏表，说“薛继考起义立功”，然后自己骑着驿马回都城。皇上封他为北中郎咨议参军，还赐给他冠军侯的爵位。但没过多久，事情败露，薛继考被处死。皇上封尹玄庆为射声校尉。
皇上从即位以来，就打压各位弟弟。打下广陵之后，还想把对弟弟们的限制弄得更严。沈怀文说：“汉明帝不让自己儿子和光武帝儿子一样，以前史书都把这事儿当美谈。陛下既然明白像管叔、蔡叔那样的人该杀，也希望能像对唐叔、卫康叔那样，给弟弟们一些机会。”等襄阳平定后，太宰义恭摸透了皇上的心思，又上表请求限制诸王，不让他们在边境州任职，还让他们把兵器铠甲都交出来，禁止他们结交宾客。沈怀文坚决反对，觉得这样不行，皇上才没这么做。
皇上打猎游玩没个节制，有一次出去，晚上才回来，让人开门。侍中谢庄负责留守，他觉得用来开门的符信可能有假，就坚持不奉旨开门，非要皇上亲笔诏书才肯开。后来皇上喝酒的时候，随口问谢庄：“你是想学郅君章吗？”谢庄回答说：“我听说帝王祭祀、打猎、出游，出入都得有节制。现在陛下早上出去晚上才回来，我怕有不法之徒趁机假冒旨意。所以得等陛下亲笔诏书，我才敢开门。”
北魏大旱，皇上下诏：“州郡境内，不管什么神，大小都要打扫干净，诚心祈祷；等丰收了，按神的等级祭祀。”于是那些被废除的祭祀又都恢复了。
秋天七月戊寅，北魏皇帝封他弟弟小新成为济阳王，加征东大将军，镇守平原；封天赐为汝阴王，加征南大将军，镇守虎牢；封万寿为乐浪王，加征北大将军，镇守和龙；封洛侯为广平王。
壬午，北魏皇帝去山北巡视；八月丁丑，回到平城。
戊子，封皇子刘子仁为永嘉王，刘子真为始安王。
九月甲寅初一，发生日食。
沈庆之坚决推辞司空的职位，柳元景也坚决推辞开府仪同三司的职位；皇上下诏同意了，还让沈庆之朝会的时候位置排在司空之后，俸禄和三司一样，柳元景的位置在从公之上。
沈庆之不识字，但家里一直很有钱，产业价值万金，奴仆上千。他两次给朝廷献钱千万，粮食万斛。之前有四处宅子，在娄湖还有园林房舍。沈庆之一晚上就带着子孙和亲戚搬到娄湖，把四处宅子都交给了官府。沈庆之养了很多歌姬妾室，悠闲自在没什么事儿，尽情享受生活，不是去朝贺都不出门。他的车马都很朴素，跟着的人也就三五个，碰见他的人都想不到他是三公。
甲戌，把南豫州的治所迁到湖县。丁丑，让浔阳王刘子房当南豫州刺史。
闰月戊子，皇太子妃何氏去世，谥号献妃。
壬寅，又把历阳王刘子顼改封为临海王。
冬天十月甲寅，任命南徐州刺史刘延孙为尚书左仆射，右仆射刘秀之当雍州刺史。