皇帝一直看主衣吴兴人寿寂之不顺眼，每次见到他都气得咬牙切齿。阮佃夫就把他们密谋杀掉皇帝的事儿，告诉了寿寂之，还有外监典事东阳人朱幼、细铠主南彭城人姜产之、细铠将晋陵人王敬则，以及中书舍人戴明宝。这几个人一听，都表示愿意一起干。朱幼提前在宫里宫外安排布置，让钱蓝生偷偷给刘休仁、刘休佑通风报信。当时皇帝打算南巡，他的心腹宗越等人都出去准备行装了，只有队主樊僧整在华林阁负责防守。柳光世和樊僧整是老乡，就偷偷邀请他入伙，樊僧整马上就答应了。这样算下来，参与谋划的一共有十多个人。阮佃夫担心人手不够办不成事儿，还想再拉些人进来，寿寂之说：“参与的人多了，容易泄密，不用太多人。”
当天晚上，皇帝把身边的侍卫都打发走了，和一群巫师还有几百个宫女在竹林堂玩射鬼的游戏。玩完了，正准备奏乐呢，寿寂之抽出刀就冲了进去，姜产之紧跟在后面，淳于文祖等人也都跟在他俩身后。刘休仁听到急促的脚步声，就对刘休佑说：“事儿成了！”两人就一起往景阳山跑去。皇帝看到寿寂之来了，拿起弓箭就射，没射中。宫女们吓得四处乱跑，皇帝自己也撒腿就跑，嘴里连着喊了三声“寂寂”。寿寂之追上去，就把皇帝给杀了。然后寿寂之向宫里负责守卫的人宣布：“湘东王受太皇太后的命令，除掉了暴君，现在已经平定局势了。”宫殿里的人都懵圈了，不知道该咋办。
刘休仁赶紧跑到秘书省找到湘东王，马上就跪地称臣，然后带着湘东王来到西堂，登上皇帝的宝座，接着召见各位大臣。这事儿发生得太突然了，湘东王连鞋子都跑掉了，光着脚就到了西堂，头上还戴着乌帽。坐下之后，刘休仁喊主衣给湘东王换了顶白帽。又让人准备皇帝出行的仪仗，虽然湘东王还没正式即位，但所有事情都按照皇帝的命令来执行。还宣读了太皇太后的命令，历数废帝的种种罪行，宣布让湘东王继承皇位。这时候，宗越等人刚回来，湘东王对他们很是安抚。
废帝的同母弟弟司徒、扬州刺史、豫章王刘子尚，跟他哥一样又顽劣又悖逆。己未这天，湘东王按照太皇太后的命令，赐刘子尚和会稽公主死。建安王刘休仁等人这才能够从被囚禁的地方出来，住到外面。同时，谢庄也从监狱里被放了出来。废帝的尸体还横在太医阁门口，蔡兴宗对尚书右仆射王彧说：“这废帝虽然又凶又坏，但怎么说也是天下之主，葬礼总得像个样子吧。要是就这么随便处理，天下人肯定会趁机闹事的。”于是，就把废帝葬在了秣陵县南边。
当初，湘东王的母亲沈婕妤很早就去世了，是路太后把他养大的。湘东王对路太后一直很孝顺，路太后也特别疼爱他。湘东王杀了废帝之后，为了让路太后高兴，下命令封太后弟弟的儿子休之为黄门侍郎，茂之为中书侍郎。然后论功行赏，寿寂之等十四个人都被封为县侯或者县子。
十二月庚申初一，任命东海王刘祎为中书监、太尉。提升镇军将军、江州刺史晋安王刘子勋为车骑将军、开府仪同三司。癸亥日，任命建安王刘休仁为司徒、尚书令、扬州刺史，山阳王刘休佑为荆州刺史，桂阳王休范为南徐州刺史。乙丑日，把安陆王刘子绥改封为江夏王。
丙寅日，湘东王正式登基做了皇帝，宣布大赦天下，改了年号。之前废帝在位时那些昏庸荒谬的制度和封赏，全都取消。
庚午日，任命右卫将军刘道隆为中护军。这刘道隆以前跟废帝关系特好，还曾经对建安太妃无礼。现在，建安王刘休仁要求解除自己的职务，不想跟刘道隆共事，明帝没办法，只好赐刘道隆死。
宗越、谭金、童太一这些人，虽然被新皇帝安抚了，但心里还是不踏实。新皇帝也不想让他们留在宫里，就很委婉地对他们说：“你们几个在那个残暴的朝廷里，辛苦了这么久，也该找个地方好好休养一下。那些有军队的大郡，你们随便挑。”宗越他们本来就心里犯嘀咕，一听这话，互相看了看，脸色都变了。于是就商量着要造反，还把这事儿告诉了沈攸之，沈攸之马上就向皇帝报告了。皇帝就把宗越他们抓起来，关进监狱，最后都死在了监狱里。沈攸之则又回到宫里担任直阁将军。
辛未日，把临贺王刘子产改封为南平王，晋熙王刘子舆改封为庐陵王。
壬申日，任命尚书右仆射王景文为尚书仆射。这王景文其实就是王彧，为了避讳皇帝的名字，就用字来称呼他。
乙亥日，追尊沈太妃为宣太后，她的陵墓叫崇宁陵。
之前，豫州刺史山阳王刘休佑进京朝见，让长史、南梁郡太守陈郡人殷琰代管府州事务。等刘休佑调任荆州刺史后，就任命殷琰为督豫、司二州诸军事，豫州刺史。
有关部门上奏说，路太后应该恢复以前的封号，然后搬到宫外去住，皇帝没答应。戊寅日，尊路太后为崇宪皇太后，让她住在崇宪宫，供奉的礼仪跟以前一样。还立王妃王氏为皇后，这皇后是王景文的妹妹。
同时，废除二铢钱，禁止使用鹅眼钱和綖环钱，其他的钱都可以正常流通。
江州的官员们收到皇帝的命令后，都挺高兴的，一起跑去见邓琬，说：“那个残暴的皇帝已经除掉了，殿下您又得到了开府仪同三司的高位，这对公对私都是大喜事啊。”邓琬觉得晋安王刘子勋在兄弟里排行第三，而且在寻阳起兵这事儿跟世祖当年情况一样，就觉得肯定能成功，他把命令书扔到地上说：“殿下那是要当皇帝，开府仪同三司这种事儿是我们这些人的事儿！”大家一听都惊呆了。邓琬接着就和陶亮等人开始修缮武器铠甲，向各地征兵。
袁顗到了襄阳之后，马上就和咨议参军刘胡一起修缮兵器，挑选召集士兵，还假称接到太皇太后的命令，让他们起兵。然后就竖起军旗，到处发檄文，还上表劝刘子勋赶紧登基当皇帝。
辛巳日，又把山阳王刘休佑改任为江州刺史，荆州刺史临海王刘子顼就留在原职。
之前，废帝任命邵陵王刘子元为湘州刺史，中兵参军沈仲玉负责路上的事务。他们走到鹊头的时候，听说寻阳那边起兵了，吓得不敢往前走。邓琬就派了几百人去把他们截住带了回来，还让刘子勋在桑尾竖起军旗，向建康发檄文，声称：“我立志遵循以前的典章制度，罢黜昏君，推举贤明。”还说新皇帝“杀害贤明的人，篡夺皇位，扰乱皇室的秩序，让兄弟凋零。我这些同宗兄弟，还剩下十三个，祖先的神灵有什么过错，竟然要断绝祭祀。”
郢州刺史安陆王刘子缓接到刘子勋一开始发的檄文，就想攻打废帝。后来听说废帝已经死了，就解散军队，放下武器。可紧接着又听说江州、雍州还在整军备战，郢州行事苟卞之害怕极了，马上派咨议、领中兵参军郑景玄带着军队赶紧出发，还送去了军粮。荆州行事孔道存拥戴刺史临海王刘子顼，会稽的将领们拥戴太守寻阳王刘子房，都起兵响应刘子勋。